IGBMC : Institut de la Génétique et de la Biologie Moléculaire et Cellulaire

• Chercheurs

  Luc BONNEFOND

  Jean CAVARELLI

  Vincent CURA

  Jean-Marie WURTZ

• Ingénieurs & Techniciens

  Nathalie TROFFER-CHARLIER

Biologie structurale intégrative

Biologie structurale de cibles épigénétiques

La structure de la chromatine constitue une barrière majeure à tous les mécanismes internes au noyau, et sa modulation est essentielle à une croissance cellulaire correcte. On dispose à présent d’éléments montrant clairement que des défauts de la modulation de la chromatine sont à l’origine d’une grande variété de pathologies, notamment des cancers. La configuration de la chromatine est fortement soumise aux modifications épigénétiques, qui agissent en synergie avec des facteurs de remodelage ATP-dépendants, des histones variantes et des chaperons d’histones pour réguler les mécanismes moléculaires. En combinant des techniques biochimiques et cristallographiques de pointe, nous cherchons à comprendre le remodelage de la chromatine à l’échelle moléculaire. Notre recherche porte principalement sur trois cibles : les protéine arginine méthyltransférases (PRMT), les chaperons d’histones et les histones désacétylases (HDAC). De plus, nous développons des approches rationnelles basées sur les structures pour caractériser les médiateurs moléculaires des activités biologiques de nos cibles, car elles sont souvent impliquées dans les maladies humaines. Notre équipe participe en outre à des recherches collaboratives sur plusieurs projets liés, qui exigent notre expertise spécifique. Les collaborations présentes portent sur les études structurales des complexes de cibles liées au cancer, telles que la Translationally Controlled Tumor Protein (TCTP) et l’ARNm de l’histone H4 humaine.

• Projets en cours

• Collaborations

  International:
  - Prof. Manfred Jung. Albert-Ludwigs-Universität Freiburg, Freiburg, Germany. PRMTs and HDACs
  - Prof. Wolfgang Sippl. Martin-Luther-Universität Halle-Wittenberg, Halle, Germany. HDACs
  - Prof. Fred Winston. Harvard Medical School, Boston, USA. Histone Chaperones
  - Prof. Antonello Mai, Spazienza Univerista Roma, Italie. PRMTs
  - Prof. Gianluca Sbardella, Univerista di Salerno, Italie. PRMTs
  
  National:
  - Ali Hamiche, DR CNRS, IGBMC, Illkirch. PRMTs and Histone Chaperones
  - Pascale Romby. DR CNRS, IBMC, Strasbourg. Histone Chaperones
  - Raymond Pierce. Institut Pasteur de Lille, Lille. HDACs
  - Gilbert Eriani, DR CNRS, IBMC, Strasbourg. mRNA H4
  - Catherine Teyssier, CR1 INSERM, U554, Montpellier, France. PRMTs
  - Alain Wagner, DR CNRS, Laboratory of Functional Chemo System, Strasbourg, France. PRMTs
  - Gilles Travé, DR CNRS, Oncoprotein Team, FRE CNRS 3211, ESBS, Strasbourg-Illkirch. E6 HPV, BP
  - Nicolas Winssinger, Prof UdS, ISIS, Laboratoire de Chimie Organique et Bioorganique, Strasbourg

• Prix/Distinctions

• Actualites

  • 3 mars 2014 - L’Europe unit ses forces pour lutter contre les maladies parasitaires négligées
  • 22 janvier 2014 - Une histone variante au cœur d’un nouveau mécanisme de régulation génique.
  • 26 septembre 2013 - L'épigénétique au service des maladies négligées

• Publications

  • Hijacking DNA methyltransferase transition state analogues to produce chemical scaffolds for PRMT inhibitors.

    Halby L(1)(2), Marechal N(3)(4)(5)(6), Pechalrieu D(1), Cura V(3)(4)(5)(6), Franchini DM(1), Faux C(1), Alby F(7), Troffer-Charlier N(3)(4)(5)(6), Kudithipudi S(8), Jeltsch A(8), Aouadi W(9), Decroly E(9), Guillemot JC(9), Page P(10), Ferroud C(11), Bonnefond L(3)(4)(5)(6), Guianvarc'h D(12)(13), Cavarelli J(14)(4)(5)(6), Arimondo PB(15)(16).

    Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci 5 juin 2018 ; 373:1-15 .

  • Crystallization and Preliminary X-Ray Diffraction Analysis of a Mammal Inositol 1,3,4,5,6-Pentakisphosphate 2-Kinase.

    Franco-Echevarria E(1), Sanz-Aparicio J(1), Troffer-Charlier N(2), Poterszman A(2), Gonzalez B(3).

    Protein J Aug 2017 ; 36:240-248 .

  • Insight into the remarkable affinity and selectivity of the aminobenzosuberone scaffold for the M1 aminopeptidases family based on structure analysis.

    Peng G(1), McEwen AG(2)(3)(4)(5), Olieric V(1), Schmitt C(6), Albrecht S(6), Cavarelli J(2)(3)(4)(5), Tarnus C(6).

    Proteins Aug 2017 ; 85:1413-1421 .

  • Transition state mimics are valuable mechanistic probes for structural studies with the arginine methyltransferase CARM1.

    van Haren MJ(1), Marechal N(2), Troffer-Charlier N(2), Cianciulli A(3), Sbardella G(3), Cavarelli J(4), Martin NI(5).

    Proc Natl Acad Sci U S A 4 avril 2017 ; 114:3625-3630 .

  • SECIS-binding protein 2 interacts with the SMN complex and the methylosome for selenoprotein mRNP assembly and translation.

    Gribling-Burrer AS(1), Leichter M(1), Wurth L(1), Huttin A(2), Schlotter F(2), Troffer-Charlier N(3), Cura V(3), Barkats M(4), Cavarelli J(3), Massenet S(2), Allmang C(1).

    Nucleic Acids Res 19 mai 2017 ; 45:5399-5413 .

  • Structural studies of protein arginine methyltransferase 2 reveal its interactions with potential substrates and inhibitors.

    Cura V(1), Marechal N(1), Troffer-Charlier N(1), Strub JM(2), van Haren MJ(3), Martin NI(3), Cianferani S(2), Bonnefond L(1), Cavarelli J(1).

    FEBS J Jan 2017 ; 284:77-96 .

  • TCTP contains a BH3-like domain, which instead of inhibiting, activates Bcl-xL.

    Thébault S(1,)(2), Agez M(1,)(3), Chi X(4,)(5), Stojko J(6), Cura V(1), Telerman SB(7,)(8), Maillet L(9), Gautier F(9,)(10), Billas-Massobrio I(1), Birck C(1), Troffer-Charlier N(1), Karafin T(2,)(3), Honoré J(3), Senff-Ribeiro A(2,)(3), Montessuit S(11), Johnson CM(8), Juin P(9,)(10), Cianférani S(6), Martinou JC(11), Andrews DW(4,)(5), Amson R(2,)(3), Telerman A(2,)(3), Cavarelli J(1).

    Sci Rep 27 janvier 2016 ; 6:19725 .

  • Functional insights from high resolution structures of mouse protein arginine methyltransferase 6.

    Bonnefond L(1), Stojko J(2), Mailliot J(1), Troffer-Charlier N(1), Cura V(1), Wurtz JM(1), Cianférani S(2), Cavarelli J(3).

    J Struct Biol Aug 2015 ; 191:175-83 .

  • Structure of the Elongator cofactor complex Kti11/Kti13 provides insight into the role of Kti13 in Elongator-dependent tRNA modification.

    Kolaj-Robin O(1), McEwen AG, Cavarelli J, Séraphin B.

    FEBS J Mar 2015 ; 282:819-33 .

  • Structural insight into arginine methylation by the mouse protein arginine methyltransferase 7: a zinc finger freezes the mimic of the dimeric state into a single active site.

    Cura V, Troffer-Charlier N, Wurtz JM, Bonnefond L, Cavarelli J.

    Acta Crystallogr D Biol Crystallogr 1 septembre 2014 ; 70:2401-12 .

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  • Etude Structurale Et Fonctionnelle D’Une Protéine Arginine Methyltransférase Et De Ces Complexes Biologiquement Significatifs. (H/F)