IGBMC : Institut de la Génétique et de la Biologie Moléculaire et Cellulaire

• Chercheurs

  Stephan COLLINS

  Christel DEPIENNE

  Binnaz YALCIN

• Doctorants

  Perrine KRETZ

• Ingénieurs & Techniciens

  Marie-Christine FISCHER

  Christel WAGNER

Médecine translationnelle et neurogénétique

Base génétique des maladies cognitives

Les maladies cognitives représentent 5 à 10% des coûts de santé publique et sont parmi les maladies les plus souvent rencontrées dans les services de pédiatrie, neurologie et génétique médicale.

La déficience intellectuelle est la plus sévère et fréquente des maladies cognitives, et affecte 1 à 3% de la population générale pourtant, peu de choses sont encore connues sur les mécanismes sous-jacents impliqués dans ces maladies. Selon les estimations, la moitié des cas non diagnostiqués de déficience intellectuelle aurait une cause génétique. On suggère même que jusqu'à 2500 gènes supplémentaires pourraient être, dans les prochaines années, impliqués dans la déficience intellectuelle.

Un des objectifs principaux de nos études est d’identifier les gènes et les réseaux de gènes associés aux fonctions cognitives, en utilisant la souris comme modèle animal.

Par le biais d’une collaboration étroite avec le «International Knockout Mouse Consortium» (IKMC), dont le but est de créer et caractériser des lignées de souris knockout pour les 20’000 gènes du génome murin, nous analysons l’impact de tous ces gènes knockout sur l’anatomie cérébrale, de façon systématique et non biaisée. Nous nous impliquons également dans l’étude génétique du syndrome de micro-délétion 16p11.2, qui est le syndrome le plus fréquemment rencontré chez les patients autistiques, et se caractérise par un retard du développement et par des malformations cérébrales comme la macrocéphalie.

En parallèle à ces approches génétiques à haut débit, nous développons des approches fonctionnelles complémentaires, principalement axées sur la compréhension biologique des malformations cérébrales. Nous étudions plusieurs de ces gènes (Wdr47, Ino80e, Mapk3, Mvp, Doc2a, et Tbx6) avec, pour objectif, de déterminer leur fonction au niveau cérébrale, ainsi que les conséquences de leur inactivation sur l’organisme entier.

Ainsi, nous abordons ces questions dans un contexte multidisciplinaire, combinant la génétique humaine et celle de la souris, les approches génomiques à grande échelle et les études fonctionnelles, dans le but ultime de déchiffrer les causes génétiques des maladies cognitives associées à des malformations cérébrales et ainsi, améliorer le diagnostique clinique et le traitement des patients.

• Projets en cours

• Collaborations

• Prix/Distinctions

  • Binnaz YALCIN - Chaire Gutenberg - Cercle Gutenberg / Région Alsace - 2015

• Actualites

  • 18 octobre 2017 - Le gène WDR47, indispensable au développement du cerveau
  • 27 février 2017 - Découverte d’un gène dont les mutations entrainent un défaut isolé de développement du cerveau

• Publications

  • DCC mutation update: Congenital mirror movements, isolated agenesis of the corpus callosum, and developmental split brain syndrome.

    Marsh APL(1)(2), Edwards TJ(3)(4), Galea C(5), Cooper HM(3), Engle EC(6)(7)(8)(9)(10)(11), Jamuar SS(6)(7)(8)(12)(13), Meneret A(14)(15), Moutard ML(16)(17)(18), Nava C(14)(19), Rastetter A(14), Robinson G(20), Rouleau G(21)(22), Roze E(14)(15), Spencer-Smith M(23)(24), Trouillard O(14), Billette de Villemeur T(16)(17)(25)(26), Walsh CA(6)(7)(8)(9)(11)(12), Yu TW(6)(11)(12); IRC5 Consortium, Heron D(17)(19), Sherr EH(27), Richards LJ(3)(28), Depienne C(14)(19)(29)(30), Leventer RJ(2)(31)(32), Lockhart PJ(1)(2).

    Hum Mutat Jan 2018 ; 39:23-39 .

  • WD40-repeat 47, a microtubule-associated protein, is essential for brain development and autophagy.

    Kannan M(1)(2)(3)(4)(5), Bayam E(1)(2)(3)(4), Wagner C(1)(2)(3)(4), Rinaldi B(6), Kretz PF(1)(2)(3)(4), Tilly P(1)(2)(3)(4), Roos M(7), McGillewie L(8), Bar S(6), Minocha S(5), Chevalier C(1)(2)(3)(4), Po C(9); Sanger Mouse Genetics Project, Chelly J(1)(2)(3)(4), Mandel JL(1)(2)(3)(4), Borgatti R(10), Piton A(1)(2)(3)(4), Kinnear C(8), Loos B(7), Adams DJ(11), Herault Y(1)(2)(3)(4), Collins SC(1)(2)(3)(4)(12), Friant S(6), Godin JD(1)(2)(3)(4), Yalcin B(13)(2)(3)(4).

    Proc Natl Acad Sci U S A 12 octobre 2017 ; 114:E9308-E9317 .

  • The Immune Signaling Adaptor LAT Contributes to the Neuroanatomical Phenotype of 16p11.2 BP2-BP3 CNVs.

    Loviglio MN(1), Arbogast T(2), Jnch AE(3), Collins SC(4), Popadin K(5), Bonnet CS(2), Giannuzzi G(1), Maillard AM(3), Jacquemont S(3); 16p11.2 Consortium, Yalcin B(6), Katsanis N(2), Golzio C(7), Reymond A(8).

    Am J Hum Genet 5 octobre 2017 ; 101:564-577 .

  • Mutations in the netrin-1 gene cause congenital mirror movements.

    Meneret A(1)(2), Franz EA(3), Trouillard O(1), Oliver TC(4), Zagar Y(5), Robertson SP(6), Welniarz Q(1)(7), Gardner RJM(6), Gallea C(1), Srour M(8)(9), Depienne C(1)(10)(11), Jasoni CL(12), Dubacq C(7), Riant F(13)(14), Lamy JC(1), Morel MP(7), Guerois R(15), Andreani J(15), Fouquet C(7), Doulazmi M(16), Vidailhet M(1)(2), Rouleau GA(8)(17)(18), Brice A(1)(19), Chedotal A(5), Dusart I(7), Roze E(1)(2), Markie D(4).

    J Clin Invest 1 novembre 2017 ; 127:3923-3936 .

  • Rare Copy Number Variants in NRXN1 and CNTN6 Increase Risk for Tourette Syndrome.

    Huang AY(1), Yu D(2), Davis LK(3), Sul JH(4), Tsetsos F(5), Ramensky V(6), Zelaya I(1), Ramos EM(4), Osiecki L(7), Chen JA(1), McGrath LM(8), Illmann C(7), Sandor P(9), Barr CL(10), Grados M(11), Singer HS(11), Nothen MM(12), Hebebrand J(13), King RA(14), Dion Y(15), Rouleau G(16), Budman CL(17), Depienne C(18), Worbe Y(19), Hartmann A(19), Muller-Vahl KR(20), Stuhrmann M(21), Aschauer H(22), Stamenkovic M(23), Schloegelhofer M(23), Konstantinidis A(24), Lyon GJ(25), McMahon WM(26), Barta C(27), Tarnok Z(28), Nagy P(28), Batterson JR(29), Rizzo R(30), Cath DC(31), Wolanczyk T(32), Berlin C(33), Malaty IA(34), Okun MS(34), Woods DW(35), Rees E(36), Pato CN(37), Pato MT(37), Knowles JA(38), Posthuma D(39), Pauls DL(7), Cox NJ(3), Neale BM(40), Freimer NB(4), Paschou P(5), Mathews CA(41), Scharf JM(42), Coppola G(43); Tourette Syndrome Association International Consortium for Genetics (TSAICG); Gilles de la Tourette Syndrome GWAS Replication Initiative (GGRI).

    Neuron 21 juin 2017 ; 94:1101-1111 .

  • Behavioural characterization of AnkyrinG deficient mice, a model for ANK3 related disorders.

    van der Werf IM(1), Van Dam D(2), Missault S(3), Yalcin B(4), De Deyn PP(5), Vandeweyer G(6), Kooy RF(7).

    Behav Brain Res 11 avril 2017 ; 328:218-226 .

  • A novel homozygous change of CLCN2 (p.His590Pro) is associated with a subclinical form of leukoencephalopathy with ataxia (LKPAT).

    Giorgio E(1), Vaula G(2), Benna P(3)(4), Lo Buono N(5)(6), Eandi CM(7), Dino D(8), Mancini C(1), Cavalieri S(9), Di Gregorio E(9), Pozzi E(1), Ferrero M(1), Giordana MT(2)(3), Depienne C(10)(11), Brusco A(1)(9).

    J Neurol Neurosurg Psychiatry Oct 2017 ; 88:894-896 .

  • GRIN2B encephalopathy: novel findings on phenotype, variant clustering, functional consequences and treatment aspects.

    Platzer K(1), Yuan H(2)(3), Schutz H(4), Winschel A(4), Chen W(2), Hu C(2), Kusumoto H(2), Heyne HO(1), Helbig KL(5), Tang S(5), Willing MC(6), Tinkle BT(7), Adams DJ(8), Depienne C(9)(10)(11)(12), Keren B(9)(10), Mignot C(10), Frengen E(13), Strmme P(14), Biskup S(15), Docker D(15), Strom TM(16), Mefford HC(17), Myers CT(17), Muir AM(17), LaCroix A(17), Sadleir L(18), Scheffer IE(19), Brilstra E(20), van Haelst MM(20), van der Smagt JJ(20), Bok LA(21), Mller RS(22)(23), Jensen UB(24), Millichap JJ(25), Berg AT(25), Goldberg EM(26)(27), De Bie I(28), Fox S(28), Major P(29), Jones JR(30), Zackai EH(31), Abou Jamra R(1)(32), Rolfs A(32), Leventer RJ(33)(34), Lawson JA(35), Roscioli T(36), Jansen FE(37), Ranza E(38), Korff CM(39), Lehesjoki AE(40)(41), Courage C(40)(41), Linnankivi T(42), Smith DR(43), Stanley C(43), Mintz M(44), McKnight D(45), Decker A(45), Tan WH(46), Tarnopolsky MA(47), Brady LI(47), Wolff M(48), Dondit L(49), Pedro HF(50), Parisotto SE(50), Jones KL(51), Patel AD(52)(53), Franz DN(54), Vanzo R(55), Marco E(56), Ranells JD(57), Di Donato N(58), Dobyns WB(59)(60)(61), Laube B(4), Traynelis SF(2)(3), Lemke JR(1).

    J Med Genet Jul 2017 ; 54:460-470 .

  • Genetic and phenotypic dissection of 1q43q44 microdeletion syndrome and neurodevelopmental phenotypes associated with mutations in ZBTB18 and HNRNPU.

    Depienne C(1,)(2,)(3,)(4,)(5), Nava C(6,)(7,)(8), Keren B(6,)(7), Heide S(7,)(9), Rastetter A(6), Passemard S(10,)(11,)(12), Chantot-Bastaraud S(13), Moutard ML(14,)(15,)(16), Agrawal PB(17), VanNoy G(17), Stoler JM(17), Amor DJ(18,)(19), Billette de Villemeur T(12,)(14,)(15,)(20), Doummar D(14,)(16), Alby C(21,)(22), Cormier-Daire V(23,)(22), Garel C(24), Marzin P(7), Scheidecker S(25), de Saint-Martin A(26,)(27), Hirsch E(26,)(28), Korff C(29), Bottani A(30), Faivre L(31,)(32), Verloes A(11), Orzechowski C(33), Burglen L(12,)(34,)(35), Leheup B(36), Roume J(37), Andrieux J(38), Sheth F(39), Datar C(40), Parker MJ(41), Pasquier L(42), Odent S(42,)(43,)(44), Naudion S(45), Delrue MA(45,)(46), Le Caignec C(47,)(48), Vincent M(47), Isidor B(47,)(48), Renaldo F(10,)(14), Stewart F(49), Toutain A(50), Koehler U(51), Hackl B(52), von Stulpnagel C(52), Kluger G(52,)(53), Mller RS(54,)(55,)(8), Pal D(56,)(8), Jonson T(57), Soller M(58), Verbeek NE(59), van Haelst MM(59), de Kovel C(59), Koeleman B(59,)(60,)(8), Monroe G(59,)(60), van Haaften G(59,)(60); DDD Study, Attie-Bitach T(21,)(22), Boutaud L(21,)(22), Heron D(7,)(9,)(20), Mignot C(61,)(62,)(63,)(64).

    Hum Genet Apr 2017 ; 136:463-479 .

  • Copy Number Variations Found in Patients with a Corpus Callosum Abnormality and Intellectual Disability.

    Heide S(1), Keren B(2), Billette de Villemeur T(3), Chantot-Bastaraud S(4), Depienne C(5), Nava C(6), Mignot C(7), Jacquette A(7), Fonteneau E(2), Lejeune E(2), Mach C(2), Marey I(7), Whalen S(8), Lacombe D(9), Naudion S(9), Rooryck C(9), Toutain A(10), Caignec CL(11), Haye D(12), Olivier-Faivre L(13), Masurel-Paulet A(13), Thauvin-Robinet C(13), Lesne F(7), Faudet A(7), Ville D(14), des Portes V(14), Sanlaville D(15), Siffroi JP(4), Moutard ML(3), Heron D(16).

    J Pediatr 8 mars 2017 ; 185:160-166 .

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