IGBMC : Institut de la Génétique et de la Biologie Moléculaire et Cellulaire

• Chercheurs

  Frédéric COIN

  Emmanuel COMPE

  Jean-Marc EGLY

  Nicolas LE MAY

• Post-Doctorants

  Sergey ALEKSEEV

  Carlos Mario GENES ROBLES

  Zita NAGY

• Doctorants

  Pietro BERICO

  Baptiste BIDON

  Federico COSTANZO

  Jérémy SANDOZ

  Maryssa SEMER

• Ingénieurs & Techniciens

  Cathy BRAUN

  Philippe CATEZ

  Annabel LARNICOL

• Assistant Administratif

  Valérie SCHON

• Master

  Antoine DUGORD

• Stagiaire

  Maria CIOBANU

Génomique fonctionnelle et cancer

Expression et réparation du génome

La transcription, l’une des étapes clés de l’expression génique en réponse à divers stimuli de l’organisme, tels que le stress ou les hormones, exige une combinaison de facteurs. L’action néfaste d'agents chimiques ou physiques qui provoquent des lésions dans l’ADN perturbe l'expression des gènes. Si ces lésions ne sont pas éliminées par des systèmes de réparation efficaces, elles seront à l’origine de mutations pouvant mener au cancer ou accentuer le vieillissement. TFIIH, un complexe composé de dix sous-unités, joue un rôle clé à la fois dans la transcription des gènes et dans leur réparation. Des mutations de certaines des sous-unités du TFIIH sont à l’origine de trois maladies génétiques (le xeroderma pigmentosum (XP), la trichotyodystrophie (TTD) et le syndrome de Cockayne (CS)), dont le phénotype résulte de défauts à la fois de réparation de l’ADN et d’expression génique. Par exemple, les patients atteints de TTD présentent des cheveux et des ongles cassants, qui ne peuvent s’expliquer que par un défaut de la réparation de l’ADN, et qui peuvent être reproduits dans des modèles murins de la TTD. Avec l’aide de la biochimie, de la génétique et de la biologie cellulaire, nous étudions les mécanismes de vieillissement et de cancer dans divers systèmes cellulaires et modèles animaux déficients en réparation et transcription de l’ADN.

• Projets en cours

  Notre objectif est d'améliorer notre compréhension des mécanismes qui régulent l'expression des gènes codant pour des protéines au niveau transcriptionnel et leur maintien de leur intégrité. La quantité grandissante de données montre que l'expression et le maintien de l'intégrité de l'information génétique sont intimement liés. Des erreurs dans chacun de ces mécanismes cellulaires cruciaux entraînent des maladies somatiques ou héréditaires comme le cancer, mais sont également impliquées dans des mécanismes naturels comme le vieillissement.
  Notre équipe tente de répondre aux questions suivantes:
  • Comment les facteurs de réparation et de transcription participent-ils à la transactivation de gènes spécifiques?
  • Comment la transcription est-elle liée à la réparation de l'ADN?
  • Comment les mutations trouvées dans des maladies génétiques ont elles une incidence sur le programme transcriptionnel d'une cellule spécifique à l'origine de maladies somatiques comme le cancer ou les dysfonctionnements hormonaux?
  • Comment l'efficacité de la suppression des lésions de l'ADN joue-t-elle un rôle dans le traitement du cancer ou dans le veillissement?
  Dans des études plus appliquées, nous aimerions utiliser des cellules IPs provenant de patients dans les mécanismes de réparation de l’ADN afin de corriger certains phénotypes de patients.

• Collaborations

  - Dr J. Hoeijmakers, ERASMUS University, Rotterdam, Netherlands
  - Pr J. Kraemer, National Cancer Institute, Bethesda, USA
  - Pr. M. Zurita, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico
  - Pr. E. Borrelli, University of California, Irvine, California, USA
  - Dr. J. Svestrup, Clare Hall Laboratories, Cancer Research UK London Research Institute, UK
  - Dr. P. Brousset, Université Paul-Sabatier, Toulouse, France

• Prix/Distinctions

  • Frédéric COIN - Prix scientifique - Comité Alsace de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 2014
  • Nicolas LE MAY - Prix Olga Sain - La ligue contre le cancer - 2013
  • Jean-Marc EGLY - Grand Prix - Fondation pour la recherche médicale (FRM) - 2012
  • Jean-Marc EGLY - Prix Henry et Mary-Jane Mitjaville - Académie Nationale de Médecine - 2009
  • Jean-Marc EGLY - Prix Duquesne - Ligue Nationale contre le Cancer de Paris - 2009
  • Frédéric COIN - Prix Charles-Louis de Saulses de Freycinet - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2008
  • Jean-Marc EGLY - ERC Advanced grant - European Research Council (ERC) - 2008
  • Jean-Marc EGLY - Membre de l'Académie des sciences - Académie des sciences - 2006
  • Jean-Marc EGLY - Chevalier de la Légion d’Honneur - Etat français - 2006
  • Jean-Marc EGLY - Grand Prix - Inserm - 2004
  • Jean-Marc EGLY - Prix AGF/Athena - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2002
  • Jean-Marc EGLY - Prix Descartes - European Economic Community - 2000
  • Jean-Marc EGLY - Membre de l'organisation européenne de biologie moléculaire (EMBO) - European Molecular Biology Organization (EMBO) - 1998
  • Jean-Marc EGLY - Prix Européen Jeanne Loubaresse - Institut Curie - 1997
  • Jean-Marc EGLY - Chevalier de l'Ordre National du Mérite - Etat français - 1996
  • Jean-Marc EGLY - Prix Tartois - Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 1996

• Actualites

  • 2 février 2017 - La transcription se remet en question
  • 25 août 2014 - Mieux comprendre la réparation de l’ADN et les maladies associées
  • 6 février 2014 - Améliorer la chimiothérapie en empêchant la réparation des cellules tumorales
  • 4 juillet 2013 - S’arrêter pour mieux continuer…
  • 25 octobre 2012 - PARG : une nouvelle piste pour les traitements anti-cancéreux ?
  • 26 août 2011 - Une signature moléculaire de la déficience intellectuelle
  • 9 avril 2010 - L'ADN et ses complexes

• Publications

  • MED12-related XLID disorders are dose-dependent of immediate early genes (IEGs) expression.

    Donnio LM(1), Bidon B(1), Hashimoto S(1,)(2), May M(3), Epantchintsev A(1), Ryan C(1), Allen W(4), Hackett A(5), Gecz J(6), Skinner C(3), Stevenson RE(3), de Brouwer AP(7), Coutton C(8), Francannet C(9), Jouk PS(8), Schwartz CE(3), Egly JM(1).

    Hum Mol Genet 24 mars 2017 .

  • Transcription without XPB Establishes a Unified Helicase-Independent Mechanism of Promoter Opening in Eukaryotic Gene Expression.

    Alekseev S(1), Nagy Z(1), Sandoz J(1), Weiss A(1), Egly JM(1), Le May N(1), Coin F(2).

    Mol Cell 2 février 2017 ; 65:504-514 .

  • Influenza virus NS1 protein binds cellular DNA to block transcription of antiviral genes.

    Anastasina M(1), Le May N(2), Bugai A(3), Fu Y(4), Söderholm S(5), Gaelings L(4), Ohman T(5), Tynell J(6), Kyttänen S(4), Barboric M(3), Nyman TA(7), Matikainen S(3), Julkunen I(8), Butcher SJ(5), Egly JM(9), Kainov DE(10).

    Biochim Biophys Acta november 2016 2016 ; 1859:1440-1448 .

  • Lurbinectedin Specifically Triggers the Degradation of Phosphorylated RNA Polymerase II and the Formation of DNA Breaks in Cancer Cells.

    Santamaría Nuñez G, Robles CM, Giraudon C(2), Martínez-Leal JF(1), Compe E(2), Coin F(2), Aviles P(1), Galmarini CM(3), Egly JM(2).

    Mol Cancer Ther october 2016 2016 ; 15:2399-2412 .

  • Nucleotide Excision Repair and Transcriptional Regulation: TFIIH and Beyond.

    Compe E(1), Egly JM(1).

    Annu Rev Biochem 2 juin 2016 ; 85:265-90 .

  • Correction: ZFC3H1, a Zinc Finger Protein, Modulates IL-8 Transcription by Binding with Celastramycin A, a Potential Immune Suppressor.

    Tomita T, Ieguchi K, Coin F, Kato Y, Kikuchi H, Oshima Y, Kurata S, Maru Y.

    PLoS One 11 septembre 2015 ; 10:e0138262 .

  • IL-6, IL-8, MMP-2, MMP-9 are overexpressed in Fanconi anemia cells through a NF-B/TNF-alpha dependent mechanism.

    Epanchintsev A(1), Shyamsunder P(2), Verma RS(2), Lyakhovich A(3,)(4,)(5).

    Mol Carcinog Dec 2015 ; 54:1686-99 .

  • Revisiting the Function of CDK7 in Transcription by Virtue of a Recently Described TFIIH Kinase Inhibitor.

    Coin F(1), Egly JM(2).

    Mol Cell 20 août 2015 ; 59:513-4 .

  • Crystal structure of the Rad3/XPD regulatory domain of Ssl1/p44.

    Kim JS(1), Saint-André C(2), Lim HS(1), Hwang CS(1), Egly JM(3), Cho Y(4).

    J Biol Chem 27 mars 2015 ; 290:8321-30 .

  • Orchestral maneuvers at the damaged sites in nucleotide excision repair.

    Alekseev S(1), Coin F.

    Cell Mol Life Sci Jun 2015 ; 72:2177-86 .

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• Recrutement

  • Rôles Transcriptionnels Des Facteurs De Réparation Csa Et Csb. (H/F)
  • Roles Des Facteurs De Réparation De L'Adn Xpa Et Xpf Dans La Régulation De L'Expression Des Gènes (H/F)

• Alumni

• Vidéos

  • Réparer l'ADN : Nucleotide Excision Repair (NER)

• Sujets de thèse

  • Rôles Transcriptionnels Des Facteurs De Réparation Csa Et Csb. (H/F)
  • Roles Des Facteurs De Réparation De L'Adn Xpa Et Xpf Dans La Régulation De L'Expression Des Gènes (H/F)