IGBMC : Institut de la Génétique et de la Biologie Moléculaire et Cellulaire

• Chercheurs

  Frédéric COIN

  Emmanuel COMPE

  Jean-Marc EGLY

  Nicolas LE MAY

• Post-Doctorants

  Federico COSTANZO

  François PEYRESAUBES

• Doctorants

  Pietro BERICO

  Li-Chiao CHIA

  Jérémy SANDOZ

• Ingénieurs & Techniciens

  Cathy BRAUN

  Philippe CATEZ

• Assistante De Direction

  Valérie SCHON

• Master

  Max CIGRANG

Génomique fonctionnelle et cancer

Expression et réparation du génome

La transcription, l’une des étapes clés de l’expression génique en réponse à divers stimuli de l’organisme, tels que le stress ou les hormones, exige une combinaison de facteurs. L’action néfaste d'agents chimiques ou physiques qui provoquent des lésions dans l’ADN perturbe l'expression des gènes. Si ces lésions ne sont pas éliminées par des systèmes de réparation efficaces, elles seront à l’origine de mutations pouvant mener au cancer ou accentuer le vieillissement. TFIIH, un complexe composé de dix sous-unités, joue un rôle clé à la fois dans la transcription des gènes et dans leur réparation. Des mutations de certaines des sous-unités du TFIIH sont à l’origine de trois maladies génétiques (le xeroderma pigmentosum (XP), la trichotyodystrophie (TTD) et le syndrome de Cockayne (CS)), dont le phénotype résulte de défauts à la fois de réparation de l’ADN et d’expression génique. Par exemple, les patients atteints de TTD présentent des cheveux et des ongles cassants, qui ne peuvent s’expliquer que par un défaut de la réparation de l’ADN, et qui peuvent être reproduits dans des modèles murins de la TTD. Avec l’aide de la biochimie, de la génétique et de la biologie cellulaire, nous étudions les mécanismes de vieillissement et de cancer dans divers systèmes cellulaires et modèles animaux déficients en réparation et transcription de l’ADN.

• Projets en cours

  Notre objectif est d'améliorer notre compréhension des mécanismes qui régulent l'expression des gènes codant pour des protéines au niveau transcriptionnel et leur maintien de leur intégrité. La quantité grandissante de données montre que l'expression et le maintien de l'intégrité de l'information génétique sont intimement liés. Des erreurs dans chacun de ces mécanismes cellulaires cruciaux entraînent des maladies somatiques ou héréditaires comme le cancer, mais sont également impliquées dans des mécanismes naturels comme le vieillissement.
  Notre équipe tente de répondre aux questions suivantes:
  • Comment les facteurs de réparation et de transcription participent-ils à la transactivation de gènes spécifiques?
  • Comment la transcription est-elle liée à la réparation de l'ADN?
  • Comment les mutations trouvées dans des maladies génétiques ont elles une incidence sur le programme transcriptionnel d'une cellule spécifique à l'origine de maladies somatiques comme le cancer ou les dysfonctionnements hormonaux?
  • Comment l'efficacité de la suppression des lésions de l'ADN joue-t-elle un rôle dans le traitement du cancer ou dans le veillissement?
  Dans des études plus appliquées, nous aimerions utiliser des cellules IPs provenant de patients dans les mécanismes de réparation de l’ADN afin de corriger certains phénotypes de patients.

• Collaborations

  - Dr J. Hoeijmakers, ERASMUS University, Rotterdam, Netherlands
  - Pr J. Kraemer, National Cancer Institute, Bethesda, USA
  - Pr. M. Zurita, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico
  - Pr. E. Borrelli, University of California, Irvine, California, USA
  - Dr. J. Svestrup, Clare Hall Laboratories, Cancer Research UK London Research Institute, UK
  - Dr. P. Brousset, Université Paul-Sabatier, Toulouse, France

• Prix/Distinctions

  • Frédéric COIN - Prix scientifique - Comité Alsace de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 2014
  • Nicolas LE MAY - Prix Olga Sain - La ligue contre le cancer - 2013
  • Jean-Marc EGLY - Grand Prix - Fondation pour la recherche médicale (FRM) - 2012
  • Jean-Marc EGLY - Prix Henry et Mary-Jane Mitjaville - Académie Nationale de Médecine - 2009
  • Jean-Marc EGLY - Prix Duquesne - Ligue Nationale contre le Cancer de Paris - 2009
  • Frédéric COIN - Prix Charles-Louis de Saulses de Freycinet - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2008
  • Jean-Marc EGLY - ERC Advanced grant - European Research Council (ERC) - 2008
  • Jean-Marc EGLY - Membre de l'Académie des sciences - Académie des sciences - 2006
  • Jean-Marc EGLY - Chevalier de la Légion d’Honneur - Etat français - 2006
  • Jean-Marc EGLY - Grand Prix - Inserm - 2004
  • Jean-Marc EGLY - Prix AGF/Athena - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2002
  • Jean-Marc EGLY - Prix Descartes - European Economic Community - 2000
  • Jean-Marc EGLY - Membre de l'organisation européenne de biologie moléculaire (EMBO) - European Molecular Biology Organization (EMBO) - 1998
  • Jean-Marc EGLY - Prix Européen Jeanne Loubaresse - Institut Curie - 1997
  • Jean-Marc EGLY - Chevalier de l'Ordre National du Mérite - Etat français - 1996
  • Jean-Marc EGLY - Prix Tartois - Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 1996

• Actualites

  • 13 septembre 2018 - 2017, une année avec le CNRS en Alsace
  • 4 juillet 2018 - Des défauts de transcription liés au facteur XPC mis en cause dans la maladie des enfants de la lune
  • 7 décembre 2017 - AFT3, une nouvelle cible pour les traitements anticancéreux
  • 2 février 2017 - La transcription se remet en question
  • 25 août 2014 - Mieux comprendre la réparation de l’ADN et les maladies associées
  • 6 février 2014 - Améliorer la chimiothérapie en empêchant la réparation des cellules tumorales
  • 4 juillet 2013 - S’arrêter pour mieux continuer…
  • 25 octobre 2012 - PARG : une nouvelle piste pour les traitements anti-cancéreux ?
  • 26 août 2011 - Une signature moléculaire de la déficience intellectuelle
  • 9 avril 2010 - L'ADN et ses complexes

• Publications

  • Conducting the CTD orchestra.

    Genes Robles CM(1), Coin F(2).

    Nat Chem Biol 31 décembre 2018 .

  • C1D is not directly involved in the repair of UV-damaged DNA but protects cells from oxidative stress by regulating gene expressions in human cell lines.

    Tomita T(1), Ieguchi K(1), Takita M(1), Tsukahara F(1), Yamada M(2), Egly JM(3), Maru Y(1).

    J Biochem 27 août 2018 .

  • XPC is an RNA polymerase II cofactor recruiting ATAC to promoters by interacting with E2F1.

    Bidon B(1)(2)(3)(4), Iltis I(1)(2)(3)(4), Semer M(1)(2)(3)(4), Nagy Z(1)(2)(3)(4), Larnicol A(1)(2)(3)(4), Cribier A(5), Benkirane M(5), Coin F(6)(7)(8)(9), Egly JM(10)(11)(12)(13), Le May N(14)(15)(16)(17).

    Nat Commun 4 juillet 2018 ; 9:2610 .

  • Is TFIIH the new Achilles heel of cancer cells?

    Berico P(1)(2)(3)(4), Coin F(1)(2)(3)(4).

    Transcription 2018 ; 9:47-51 .

  • Cockayne's Syndrome A and B Proteins Regulate Transcription Arrest after Genotoxic Stress by Promoting ATF3 Degradation.

    Epanchintsev A(1), Costanzo F(1), Rauschendorf MA(1), Caputo M(2), Ye T(1), Donnio LM(1), Proietti-de-Santis L(2), Coin F(1), Laugel V(3), Egly JM(4).

    Mol Cell 21 décembre 2017 ; 68:1054-1066 .

  • Unified promoter opening steps in eukaryotic gene expression.

    Sandoz J(1), Coin F(1).

    Oncotarget 29 septembre 2017 ; 8:84614-84615 .

  • The intricate network between the p34 and p44 subunits is central to the activity of the transcription/DNA repair factor TFIIH.

    Radu L(1), Schoenwetter E(2), Braun C(1), Marcoux J(3), Koelmel W(2), Schmitt DR(2), Kuper J(2), Cianferani S(3), Egly JM(1), Poterszman A(1), Kisker C(2).

    Nucleic Acids Res 13 octobre 2017 ; 45:10872-10883 .

  • MED12-related XLID disorders are dose-dependent of immediate early genes (IEGs) expression.

    Donnio LM(1), Bidon B(1), Hashimoto S(1)(2), May M(3), Epanchintsev A(1), Ryan C(1), Allen W(4), Hackett A(5), Gecz J(6), Skinner C(3), Stevenson RE(3), de Brouwer APM(7), Coutton C(8), Francannet C(9), Jouk PS(8), Schwartz CE(3), Egly JM(1).

    Hum Mol Genet 1 juin 2017 ; 26:2062-2075 .

  • Transcription without XPB Establishes a Unified Helicase-Independent Mechanism of Promoter Opening in Eukaryotic Gene Expression.

    Alekseev S(1), Nagy Z(1), Sandoz J(1), Weiss A(1), Egly JM(1), Le May N(1), Coin F(2).

    Mol Cell 2 février 2017 ; 65:504-514 .

  • La chirurgie de l'Adn honoree par un prix Nobel.

    [Article in French; Abstract available in French from the publisher]

    Rev Prat Feb 2016 ; 66:226-228 .

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• Recrutement

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• Vidéos

  • Réparer l'ADN : Nucleotide Excision Repair (NER)

• Sujets de thèse

  • Tfiih Is A New Master Regulator Of Gcn5 Controlling Histone Ptms Upon Transcription (H/F)