Félicitations à Franck MARTIN pour l'acceptation de sa thèse !

Résumé de ses travaux de recherche :

La chromatine est une structure dynamique régulée par différents mécanismes épigénétiques parmi lesquels le remodelage de la chromatine dépendant de l’ATP comme le SWI/SNF. Leur importance est telle que les mutations des protéines de remodelage de la chromatine sont fortement associées à plusieurs maladies dont le cancer. Par exemple les protéines BCL7, qui sont de nouvelles sous unité centrales récemment identifié du complexe SWI/SNF des mammifère, sont associées à différents types de cancers comme dans le Diffuse Large B-cell Lymphoma (DLBCL). Les informations sur les protéines BCL7 sont à ce jour très limitées. En utilisant des approches biochimiques et structurelles, ce projet vise à mieux comprendre la structure et la fonction de ces sous unités auxiliaires. Nous rapportons ici que les protéines se lient à l’acidique patch du nucleosome avec sa regions N-terminal qui comprend un motif d’ancrage arginines et que la mutation de l’une de ces arginines impacte directement la liaison au nucleosome. Nous apportons aussi une hypothèse sur la position au sein du complexe SWI/SNF de BCL7 qui interagit avec le module ARP et plus particulièrement avec ACTB par l'intermédiaire d'un motif 2W, et qu’elles sont directement des partenaires de liaisons avec BAF47. Nous avons aussi pu identifier qu’une fois sur les nucléosomes c’est BAF47 qui prend place sur l’acidique patch et l’hélice de BCL7A est déplacé.

Compétences acquises à l'IGBMC :
Pendant ma thèse, j’ai acquis une expertise en biologie structurale, notamment en cristallographie et en cryo-microscopie électronique (cryo-EM). J’ai appris à maîtriser l’ensemble du processus, depuis la production et la purification des protéines jusqu’à la résolution de leur structure atomique.
J’ai acquis des compétences essentielles en méthodologie scientifique, en analyse critique et en gestion de projet, me permettant de mener des recherches de manière rigoureuse et organisée. Cette expérience m’a également appris l’importance du partage des connaissances, que ce soit à travers des collaborations, des présentations ou des publications, renforçant ainsi ma capacité à vulgariser et à transmettre des idées complexes. Enfin, j’ai intégré un état d’esprit de curiosité et de remise en question permanente, me poussant à toujours chercher plus loin, à approfondir mes analyses et à explorer de nouvelles pistes pour enrichir mon domaine d’étude.
 

Vie à l'IGBMC :
Ce que j’apprécie particulièrement à l’IGBMC, c’est la présence de toutes les plateformes technologiques qui offrent un accès à une large gamme de techniques complémentaires. Cette diversité permet de mener des projets de recherche de manière intégrée, en ayant presque tout à disposition sur place, de la production des échantillons jusqu’à leur analyse structurale et fonctionnelle. De plus, l’environnement de travail est extrêmement formateur : les experts des différentes plateformes prennent le temps d’expliquer, de guider et d’entraîner les chercheurs, favorisant ainsi une montée en compétences progressive et une plus grande autonomie dans l’utilisation des différentes technologies. Cet esprit de transmission et de collaboration enrichit considérablement l’expérience de recherche et encourage le développement de nouvelles compétences.
 

Ses collaborations :
Dans le cadre de mon projet, qui s’est révélé particulièrement complexe, un travail pluridisciplinaire a été nécessaire pour en explorer toutes les dimensions. Afin de mener à bien les différentes expériences, nous avons collaboré avec plusieurs équipes aux expertises complémentaires, ce qui nous a permis d’intégrer des approches variées et d’enrichir notre analyse. Certaines expériences ont ainsi été réalisées en collaboration avec des équipes à Heidelberg et à Paris, illustrant l’importance des échanges scientifiques et du travail en réseau pour surmonter les défis techniques et méthodologiques. Cette expérience m’a permis de mieux appréhender la valeur du travail collaboratif et de développer des compétences en gestion de projet et en coordination entre différentes équipes.
 

Son financement et ses partenaires :
Mes trois premières années de thèse ont été financées directement par le programme ATIP-Avenir d'Elisa Bergamin. Ma quatrième année, quant à elle, a été financée par la fondation ARC.

Projets futurs :
Pour l’avenir, j’envisage deux principales options pour poursuivre mon parcours. D’une part, j’aimerais explorer le secteur privé en intégrant une entreprise afin de découvrir un environnement de recherche appliquée et de voir comment la science se traduit dans une perspective plus industrielle. D’autre part, je suis également intéressé par l’idée de réaliser un post-doctorat dans une autre équipe à l’étranger. Cette expérience me permettrait de découvrir une nouvelle façon d’aborder la recherche, d’acquérir de nouvelles compétences et d’élargir mon réseau scientifique dans un contexte international. Quelle que soit la direction que je prendrai, mon objectif est d’élargir mes horizons et d’explorer d’autres approches de la science.