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Criblage cellulaire à haut débit

Analyse phénotypique et criblage cellulaire

RESPONSABLE DE PLATEFORME

Anne MAGLOTT-ROTH

La plateforme de criblage cellulaire à haut-débit de l'IGBMC fournit aux chercheurs une infrastructure pour l'analyse à haut-contenu cellulaire et une solution globale pour des criblages génétiques de perte/gain de fonction ou des criblages chimiques.


Les tests cellulaires et analyse d'image à haut contenu cellulaire sont conçus, développés, miniaturisés et optimisés par le personnel de la plateforme en collaboration avec les équipes de recherche. Nos technologies de modulations génétiques se basent sur l'ARN interférence et la technologie CRISPR/Cas9.


La mission primaire de la plateforme est de soutenir la recherche médicale fondamentale et translationnelle dans des sujets variés étudiés par les 4 départements de recherche de l'Institut et en particulier l'oncologie et les maladies génétiques. Associé au Pôle de compétitivité Alsace-Biovalley, Conectus-Alsace et le cancéropôle Grand Est, la plateforme est ouverte à la recherche académique en dehors de l'Institut et également à des entreprises privées.


L'étude des bases moléculaires de processus biologiques et de phénotypes cellulaires en utilisant la répression de gènes est effectuée par transfection de petits ARN interférents et imagerie à haut contenu cellulaire sur des équipements automatisés permettant de gérer le débit pour des criblages couvrant le génome entier. Les modèles cellulaires et les conditions sont fournis par les groupes de recherche mais peuvent aussi être développés par la plateforme elle-même (ingénierie cellulaire de reporteur fluorescent, production de vecteurs CRISPR/Cas9, production d'anticorps, …).


L'identification de molécules et médicaments permettant de cibler/moduler un processus biologique ou un phénotype cellulaire est réalisé en utilisant des librairies de molécules chimiques approuvées par la FDA (Selleckchem ou Prestwick).


L'analyse à haut contenu cellulaire est effectué sur des lecteurs automatisés Thermofisher Scientific Cellomics ArrayScan XTi et CX5/7.


La plateforme de Criblage Phénotypique à Haut Débit de l’IGBMC participe aux études fonctionnelles des gènes dans des conditions normales et pathologiques en fournissant une infrastructure et une équipe de d’experts en biologie cellulaire, automatisation, statistique et bioinformatique aux équipes de l’IGBMC ainsi qu’aux autres instituts de recherche strasbourgeois et de la région Grand Est. Ces prestations sont principalement :

  • La mise au point de tests cellulaires  
  • Le développement de méthodes d’analyse de phénotypes cellulaires  
  • Criblage HCS/HTS de banques siRNAs (kinome au génome) sur cellules de mammifère
  • Criblage par sélection positive et négative de banques lentivirales CRISPR-Cas9 pan-génomique (KO, activation, répression) sur cellules de mammifère
  • Criblage HCS/HTS de molécules chimiques sur cellules de mammifère

Ingénieur(eure)s

Technicien(ne)s

Soumettre un projet

La plateforme est ouverte à tous les projets cellulaires réalisables dans un niveau de confinement L2. Les bactéries et levures ne peuvent être utilisées sur la plateforme. Nous disposons de banques siRNA couvrant le génome humain et murin, de banques de molécules chimiques, de banques de gRNA. Ainsi que de microscopes automatisés pour réaliser l’analyse multi-paramètrique de vos cellules.


L’accès au laboratoire de criblage est restreint au personnel de la plateforme. Vous nous fournissez les réactifs nécessaires au projet et nous mettrons en œuvre sa réalisation.


Contactez nous par mél (anne.maglott-roth@igbmc.fr) ou par téléphone (+33 3 88 65 33 14) pour discuter de la faisabilité de votre projet.


N'hésitez pas à nous contacter pour préparer votre dossier de demande de financement.

Collaborations et réseaux

ELRIG
UMR S 1110, UPR 9002, UMR 7021, UMR 7242, UMR S 1109
SATT Conectus, Neurofit

 

 

Financements et partenaires

  • ANR,
  • ANRS,
  • INCA,
  • LNCC,
  • Ingestem,
  • Université de Strasbourg,
  • CNRS,
  • INSERM,
  • SATT Conectus Alsace

Ressources

  • Librairies génome entier Dharmacon siRNA OTP (humain et souris)
  • Librairies molécules chimiques (Selleckchem et Prestwick)
  • Librairies lentivirales sgRNA Cas9 génome entier (humain et souris)
  • Station automatisée Agilent Biocel avec pipeteur Bravo (tête 96 ou 384) dans PSM de classe II
  • Microscopes automatisés Cellomics ArrayScan XTi et CX7

 

 

Prix & distinctions

Label IBISA en 2017