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Différence fonctionnelle du complexe coactivateur de la transcription SAGA entre levures et mammifères

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Dans une étude publiée dans Nucleic Acids Research, les scientifiques s’intéressent au fonctionnement des complexes coactivateurs de la transcription par l’ARN polymérase II (Pol II). Conservé chez la levure et les mammifères, les chercheurs identifient des fonctionnements différents du complexe coactivateur de la transcription Spt Ada Gcn5 Acétyl-transférase (SAGA). Chez les deux espèces, la sous unité SUPT3H n’est pas requise pour l’assemblage de SAGA. Dans cette étude, les auteurs montrent que chez les mammifères, SUPT3H n’est également pas nécessaire pour l’initiation et la transcription globale de Pol II, n'affectant qu'un sous-ensemble de gènes chez les mammifères.

La formation du complexe de pré initiation (PIC) de la transcription est une étape majeure pour l’expression des gènes chez les eucaryotes. Indispensable pour la mise en place du PIC, l’accessibilité de la chromatine est médiée par des co-activateurs transcriptionnels tels que le complexe SAGA. Ce dernier est conservé chez les eucaryotes et a une organisation centrale octamérique semblable à un nucléosome.


Chez la levure, il a été montré que SAGA participe à la transcription de quasiment tous les gènes. De plus, deux sous unités de SAGA : Spt3, orthologue de SUPT3H, et Spt8, interagissent directement avec la protéine de liaison à la boîte TATA. : TBP Cela suggère que SAGA est aussi impliqué dans la régulation de la déposition de TBP sur les promoteurs. L’absence de Supt3 n’affecte pas la formation du complexe SAGA mais induit une diminution globale de la transcription Pol II indiquant que Supt3 contribue à la transcription de la quasi-totalité des gènes chez la levure.


Dans cette étude, les scientifiques s’intéressent au rôle de SUPT3H dans l’assemblage de SAGA, la régulation de la transcription Pol II et le recrutement de TBP sur les promoteurs dans des cellules humaines et murines. Comme observé chez la levure, l’absence de SUPT3H n’affecte pas la formation du complexe SAGA. En revanche, SUPT3H n’est requis que pour l’expression d’un nombre limité de gènes, notamment ceux impliqués dans la croissance et le renouvellement des cellules souches embryonnaires murines. L’absence de SUPT3H n’affecte pas le recrutement de TBP sur les promoteurs avec ou sans boîte TATA. Ces données suggèrent que le rôle de SUPT3H dans la régulation de la transcription a divergé au cours de l’évolution et que les complexes SAGA de levure ou des mammifères contribuent à la régulation de la transcription par différents mécanismes.

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