Félicitations à Huma RAHIL pour l'acceptation de sa thèse !

Résumé de ses travaux de recherche :
Mes travaux de doctorat ont porté sur l’élucidation des mécanismes moléculaires qui coordonnent la transcription et la traduction chez les bactéries. Bien que l’on sache que la traduction influence la transcription, cette recherche s’est intéressée au processus réciproque, c’est-à-dire à la manière dont la transcription peut favoriser l’initiation de la traduction.

À l’aide de la cryo-microscopie électronique (cryo-EM), cette étude a mis en évidence les voies structurales par lesquelles l’ARNm naissant, émergeant de l’ARN polymérase (RNAP), est acheminé vers la sous-unité ribosomique 30S. Les résultats ont révélé deux mécanismes distincts de recrutement de l’ARNm : (1) un transfert assisté par la RNAP, dans lequel la protéine ribosomique bS1 guide et stabilise les premières interactions de l’ARNm avec la sous-unité 30S, et (2) une voie de couplage direct entre la RNAP et le ribosome, médiée par le facteur de transcription NusG. Ces travaux ont également mis en évidence des intermédiaires jusqu’alors non caractérisés de l’initiation de la traduction, notamment une orientation inversée de la séquence Shine-Dalgarno/anti-Shine-Dalgarno ainsi que des états précoces de transfert de l’ARNm précédant la formation du complexe de pré-initiation. En outre, j’ai résolu l’architecture complète de la protéine bS1 et démontré son rôle central dans l’acheminement de l’ARNm via le canal de sortie de la sous-unité 30S, un mécanisme qui n’avait jamais été décrit auparavant.

Le deuxième objectif de ma thèse portait sur l’activation de la sous-unité ribosomique 30S. J’ai caractérisé le complexe 30S–RNAP en présence des facteurs d’initiation, de l’ARNt initiateur et de NusG, apportant ainsi de nouvelles connaissances sur les mécanismes d’initiation de la traduction et sur le rôle des facteurs d’initiation. Nos résultats montrent que ces facteurs modulent activement la conformation de la sous-unité 30S, favorisant ainsi l’activation du ribosome. Ces découvertes améliorent notre compréhension de la manière dont les facteurs d’initiation orchestrent les premières étapes de la traduction.

Le troisième objectif visait à étudier la manière dont les ribosomes suiveurs permettent à la RNAP de sortir d’un état de pause stabilisé par une structure en épingle à cheveux de l’ARN. Le projet a débuté par la caractérisation structurale du complexe d’élongation en pause de la RNAP d’Escherichia coli au niveau du site de pause his, largement étudié. Le complexe a été préparé de manière co-transcriptionnelle, et j’ai réussi à capturer un complexe en pause présentant une pince (« open clamp ») ouverte, stabilisé par une épingle à cheveux, apportant ainsi de nouvelles informations mécanistiques sur les réarrangements conformationnels de la RNAP lors des pauses de classe I.

Dans l’ensemble, ces travaux apportent de nouvelles connaissances structurales sur la manière dont la transcription et la traduction sont coordonnées, à la fois physiquement et fonctionnellement, au sein des cellules bactériennes. Ils contribuent ainsi à une meilleure compréhension des mécanismes de régulation de l’expression des gènes.


Compétences acquises à l'IGBMC :
Au cours de mon doctorat, j’ai appris à réfléchir et à travailler en tant que chercheur autonome. J’ai développé une expertise approfondie en biologie structurale, en cryo-microscopie électronique (cryo-EM) et dans l’étude des mécanismes moléculaires qui régissent l’expression des gènes. Ces années m’ont permis d’acquérir la capacité de concevoir et de mener des expériences complexes, d’analyser et d’interpréter des jeux de données volumineux et exigeants, ainsi que de relier les observations structurales à leur signification biologique.


Vie à l'IGBMC :
Lorsque je suis arrivée en France, j’étais terrifiée. Tout me semblait étranger : la culture, la langue, le mode de vie… J’avais peur que mon identité, ma religion et le fait de porter le hijab me distinguent d’une manière que je ne pourrais jamais surmonter.

Mais le jour où j’ai franchi les portes de l’IGBMC, quelque chose a changé en moi. Cet institut ne s’est pas contenté de m’accueillir : il m’a véritablement intégrée. J’y ai découvert une communauté scientifique résolument internationale, où j’ai été reconnue pour mes compétences, mon engagement et mes qualités scientifiques, et jamais jugée en raison de ma religion ou de mes origines.

Issue d’un milieu traditionnel et conservateur, où l’accès des femmes à l’éducation est rare, voire impensable pour beaucoup, partir étudier à l’étranger – et plus encore entreprendre un doctorat – me paraissait autrefois impossible. L’IGBMC ne m’a pas seulement offert l’opportunité de poursuivre des études supérieures ; il a permis à une jeune femme issue d’un milieu défavorisé d’oser rêver grand. Il m’a ouvert une porte dont je n’aurais jamais imaginé qu’elle puisse exister pour quelqu’un comme moi.

Je remercie sincèrement l’IGBMC de m’avoir donné l’opportunité de pouvoir dire, avec une immense fierté, que je suis la première femme de ma famille à avoir fréquenté l’université et à avoir obtenu un diplôme aussi important qu’un doctorat. Cette expérience a transformé ma vie à jamais.


Son financement et ses partenaires :
Mon doctorat a été financé par le programme doctoral IMCBio et soutenu par une bourse de quatrième année de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM).



Projets futurs :
Je souhaite poursuivre ma carrière par un stage postdoctoral et construire un parcours académique, en contribuant à la recherche tout en encadrant et en inspirant la prochaine génération de scientifiques, en particulier les femmes qui souhaitent s'engager dans les métiers de la recherche.