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Expression et réparation du génome

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Expression et réparation du génome

DÉPARTEMENT

Génomique fonctionnelle et cancer

CHEF D'ÉQUIPE

Frédéric COIN

La transcription, l’une des étapes clés de l’expression génique en réponse à divers stimuli de l’organisme, tels que le stress ou les hormones, exige une combinaison de facteurs. L’action néfaste d'agents chimiques ou physiques qui provoquent des lésions dans l’ADN perturbe l'expression des gènes. Si ces lésions ne sont pas éliminées par des systèmes de réparation efficaces, elles seront à l’origine de mutations pouvant mener au cancer ou accentuer le vieillissement. TFIIH, un complexe composé de dix sous-unités, joue un rôle clé à la fois dans la transcription des gènes et dans leur réparation. Des mutations de certaines des sous-unités du TFIIH sont à l’origine de trois maladies génétiques, le xeroderma pigmentosum (XP), la trichotyodystrophie (TTD) et le syndrome de Cockayne (CS), dont le phénotype résulte de défauts à la fois de réparation de l’ADN et d’expression génique. Les patients XP développent des mélanomes très tôt au cours de la vie alors que les patients TTD et CS vieillissent prématurément. Avec l’aide de la biochimie, de la génétique et de la biologie cellulaire, nous étudions les mécanismes de vieillissement et de cancer dans divers systèmes cellulaires et modèles animaux déficients en réparation et transcription de l’ADN. Nous développons également un axe de recherche sur le mélanome visant en particulier à établir de nouvelles solutions thérapeutiques contre ce cancer.

Projets en cours

Notre objectif est d'améliorer notre compréhension des mécanismes qui régulent l'expression des gènes codant pour des protéines au niveau transcriptionnel et leur maintien de leur intégrité. La quantité grandissante de données montre que l'expression et le maintien de l'intégrité de l'information génétique sont intimement liés. Des erreurs dans chacun de ces mécanismes cellulaires cruciaux entraînent des maladies somatiques ou héréditaires comme le cancer, mais sont également impliquées dans des mécanismes naturels comme le vieillissement.
Notre équipe tente de répondre aux questions suivantes :

  • Comment les facteurs de réparation et de transcription participent-ils à la transactivation de gènes spécifiques?
  • Comment la transcription est-elle liée à la réparation de l'ADN?
  • Comment les mutations trouvées dans des maladies génétiques ont elles une incidence sur le programme transcriptionnel d'une cellule spécifique à l'origine de maladies somatiques comme le cancer ou les dysfonctionnements hormonaux?
  • Comment l'efficacité de la suppression des lésions de l'ADN joue-t-elle un rôle dans le traitement du cancer ou dans le veillissement?
  • Peut on cibler l’expression ou la réparation de l’ADN afin d’éliminer les cellules cancéreuses ?
  • Quelles sont les deregulations transcriptionelles qui prédominent dans les cellules cancéreuses ?

Collaborations et réseaux

  • Dr. Poterszman, IGBMC: Structure/fonction de TFIIH
  • Dr. Davidson, IGBMC: TFIIH et mélanome
  • Dr. Ali Hamiche, IGBMC: Remodellage de la chromatine et histones variants 
  • Pr J. Kraemer, National Cancer Institute, Bethesda: Patients XP, CS et TTD 
  • Pr. M. Zurita, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico: Modéle drosophile et XP, CS et TTD
  • Dr. J. Svestrup, Clare Hall Laboratories, Cancer Research UK London Research Institute, UK: Expression du génome
  • Dr. P. Brousset, Université Paul-Sabatier, Toulouse, France: Biologie du cancer 

Financements et partenaires

ANR

Fondation ARC

INCA

Labélisation Ligue contre le Cancer

PharmaMar company 

Prix/Distinctions

  • Prix scientifique - Comité Alsace de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 2014
  • Prix Olga Sain - La ligue contre le cancer - 2013
  • Grand Prix - Fondation pour la recherche médicale (FRM) - 2012
  • Prix Henry et Mary-Jane Mitjaville - Académie Nationale de Médecine - 2009
  • Prix Duquesne - Ligue Nationale contre le Cancer de Paris - 2009
  • Prix Charles-Louis de Saulses de Freycinet - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2008
  • ERC Advanced grant - European Research Council (ERC) - 2008
  • Membre de l'Académie des sciences - Académie des sciences - 2006
  • Chevalier de la Légion d’Honneur - Etat français - 2006
  • Grand Prix - Inserm - 2004
  • Prix AGF/Athena - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2002
  • Prix Descartes - European Economic Community - 2000
  • Membre de l'organisation européenne de biologie moléculaire (EMBO) - European Molecular Biology Organization (EMBO) - 1998
  • Prix Européen Jeanne Loubaresse - Institut Curie - 1997
  • Chevalier de l'Ordre National du Mérite - Etat français - 1996
  • Prix Tartois - Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 1996

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

Publications

Génomique fonctionnelle et cancer - Recherche contre le cancer - Maladies rares