Contact
 

Olga Rosspopoff / nouvelle équipe - démarrage officiel en mai / juin 2026

Olga Rosspopoff / nouvelle équipe - démarrage officiel en mai / juin 2026

DÉPARTEMENT

Biologie du développement et cellules souches

Ma recherche s’intéresse à la manière dont l’innovation biologique émerge au cours de l’évolution et s’intègre aux réseaux de régulation génique (RRG) qui régissent le développement des mammifères. J’étudie des composants génomiques à évolution rapide, en particulier les éléments transposables (ETs) et les protéines à doigts de zinc à domaine KRAB (KZFPs), façonnent des RRG spécifiques à chaque espèce. 
Durant ma thèse, j’ai analysé comment des ARN longs non codants contribuent à la plasticité régulatrice lors de l’inactivation du chromosome X, en montrant comment une divergence évolutive peut s’inscrire au sein de processus développementaux fondamentaux. Lors de mon postdoctorat, j’ai mis en évidence que les ETs et les KZFPs forment des modules régulateurs qui sculptent activement les réseaux transcriptionnels au cours du développement. 
Dans l’ensemble, mes travaux ont établi que des éléments génomiques d’apparition récente peuvent constituer des moteurs puissants de l’innovation biologique.

Projets en cours

Le laboratoire EvoBluePrint vise à comprendre comment des éléments à dynamique évolutive sont mobilisés au cours des premières étapes de l’embryogenèse, avec un intérêt particulier pour la spécification des destins cellulaires. Le laboratoire étudie comment des séquences régulatrices dérivées d’ETs sont engagées de façon sélective au fil du temps développemental et selon les lignages, et comment les KZFPs modulent leur activité afin d’assurer une expression génique robuste et adaptée au lignage. En combinant génomique comparative, épigénomique et approches unicellulaires, le laboratoire cherche à disséquer la manière dont des programmes développementaux conservés sont reconfigurés par des réseaux régulateurs spécifiques à chaque espèce, et comment l’équilibre entre innovation et robustesse est maintenu au cours du développement.

 

Perspectives

Le programme de recherche du laboratoire EvoBluePrint vise à comprendre comment les ETs participent à la structuration des RRG, et comment ces mécanismes contribuent au maintien des programmes d’expression génique chez l’humain. L’identification de ces mécanismes constitue un verrou majeur, limitant la compréhension de la biologie humaine et freinant la transposition des résultats issus des modèles animaux vers la clinique. Le laboratoire aborde notamment la question de savoir comment l’activité cis-régulatrice des ETs est déployée de façon sélective au cours du développement embryonnaire humain pour structurer les RRG développementaux et, à plus long terme, comment la dérégulation de RRG impliquant des ETs pourrait affecter l’homéostasie tissulaire dans des contextes pathologiques de réactivation des ETs.

 

Lien vers le site du laboratoire : https://orspf.github.io/Rosspopoff.Lab.io/

 

Publications

  • Milovanović, D., Duc, J., Matsushima, W., Hamelin, R., Planet, E., Offner, S., Rosspopoff, O.†*, and Trono, D.†* (2026). Tissue-specific restriction of transposon-derived regulatory elements safeguards cell-type identity. Cell Reports 45, 116817. doi.org/10.1016/j.celrep.2025.116817.

* Corresponding author, † Last author

  • Rosspopoff, O.#*, Milovanović, D., Offner, S., Raclot, C., Lau, K., Duhoo, Y., Duc, J., Planet, E., Damery, C., Begnis, M., et al. (2025). Transposable element co-option drives transcription factor neofunctionalization. Preprint at bioRxiv, doi.org/10.1101/2025.03.01.640934. In revision.

# First author, *Corresponding author.

  • Martins, F., Rosspopoff, O.§, Carlevaro-Fita, J., Forey, R., Offner, S., Planet, E., Pulver, C., Pak, H., Huber, F., Michaux, J., et al. (2024). A Cluster of Evolutionarily Recent KRAB Zinc Finger Proteins Protects Cancer Cells from Replicative Stress–Induced Inflammation. Cancer Research 84, 808–826. doi.org/10.1158/0008-5472.CAN-23-1237.

§ Second author

  • Rosspopoff, O.#, Cazottes, E., Huret, C., Loda, A., Collier, A.J., Casanova, M., Rugg-Gunn, P.J., Heard, E., Ouimette, J.-F., and Rougeulle, C. (2023). Species-specific regulation of XIST by the JPX/FTX orthologs. Nucleic Acids Research 51, 2177–2194. doi.org/10.1093/nar/gkad029.

# First author

  • Rosspopoff, O.#, Trono, D., and Feschotte, C. (2025). Mix-and-match between transposable elements and zinc finger proteins fuels genic and regulatory innovation. Current Opinion in Genetics & Development 95, 102414. doi.org/10.1016/j.gde.2025.102414.

# First author

# First author

# First author

 

 

 

 

Biologie du développement et cellules souches