Biologie des Systèmes aléatoires de la régulation des gènes
Biologie des Systèmes aléatoires de la régulation des gènes
La régulation des gènes est un processus réalisé en plusieurs étapes jouant un rôle central dans l'élaboration de la réponse cellulaire à des stimuli environnementaux. Premièrement, les facteurs de transcription pionniers (TFs) reconnaissent les sites de liaison des séquences d'ADN spécifiques dans les régions promotrices de gènes et des sites de régulation. Par la suite, des enzymes spécifiques sont recrutés, modifient les queues d'histones post-traductionnel et provoquent le remodelage des nucléosomes. Les TFs supplémentaires se lient dans les régions de chromatine accessibles et enfin, l'ARN polymérase peut lancer la synthèse de l'ARNm. Ces réactions se produisent dans le noyau compact où la chromatine forme une structure complexe en 3D. Et finalement, les fluctuations aléatoires font que la dynamique de l'expression des gènes dans des cellules individuelles diffère considérablement du comportement moyen au niveau de la population.
Les nouvelles technologies expérimentales nous permettent de mesurer, les interactions protéine-ADN, les modifications post-transcriptionnel des histones et de la structure 3D de la chromatine dans le génome entier au sein des populations et plus récemment dans des cellules individuelles. En utilisant ces méthodes d’expériences Time-cours, nous présentons une occasion unique d'étudier, d'une manière quantitative, la dynamique de la régulation des gènes.
La principale activité de recherche de notre groupe est de construire des modèles biophysiques aléatoires de la régulation des gènes eucaryotes en intégrant tous ces ensembles de données. Nous utilisons des méthodes fondées sur des principes ancrés dans la bio-informatique, la statistique bayésienne (démarche logique permettant de calculer ou réviser la probabilité d'une hypothèse.), les processus aléatoires et la mécanique statistique.
Membres
Chercheur(euse)s
Post-doctorant(e)s
Doctorant(e)s
Ingénieur(eure)s
Publications
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2019
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Rfx6 promotes the differentiation of peptide-secreting enteroendocrine cells while repressing genetic programs controlling serotonin production
- Julie Piccand
- Constance Vagne
- Florence Blot
- Aline Meunier
- Anthony Beucher
- Perrine Strasser
- Mari Lund
- Sabitri Ghimire
- Laure Nivlet
- Céline Lapp
- Natalia Petersen
- Maja Engelstoft
- Christelle Thibault-Carpentier
- Céline Keime
- Sara Jimenez Correa
- Valérie Schreiber
- Nacho Molina
- Thue Schwartz
- Adèle de Arcangelis
- Gérard Gradwohl
Molecular metabolism ; Volume: 29 ; Page: 24-39
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Visualization of Endogenous Transcription Factors in Single Cells Using an Antibody Electroporation-Based Imaging Approach
- Sascha Conic
- Dominique Desplancq
- Alexia Ferrand
- Nacho Molina
- Etienne Weiss
- Làszlò Tora
Imaging Gene Expression: Methods and Protocols, ; Page: 209-221
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2018
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Multiple inputs ensure yeast cell size homeostasis during cell cycle progression, Multiple inputs ensure yeast cell size homeostasis during cell cycle progression.
- Cecilia Garmendia-Torres
- Olivier Tassy
- Audrey Matifas
- Nacho Molina
- Gilles Charvin
eLife ; Volume: 7
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Circadian clock-dependent and -independent posttranscriptional regulation underlies temporal mRNA accumulation in mouse liver
- Jingkui Wang
- Laura Symul
- Jake Yeung
- Cédric Gobet
- Jonathan Sobel
- Sarah Lück
- Pål Westermark
- Nacho Molina
- Felix Naef
Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America ; Volume: 115 ; Page: E1916-E1925
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Imaging of native transcription factors and histone phosphorylation at high resolution in live cells
- Sascha Conic
- Dominique Desplancq
- Alexia Ferrand
- Véronique Fischer
- Vincent Heyer
- Bernardo Reina San Martin
- Julien Pontabry
- Mustapha Oulad-Abdelghani
- Kishore Babu N.
- Graham Wright
- Nacho Molina
- Etienne Weiss
- Laszlo Tora
Journal of Cell Biology ; Volume: 217 ; Page: 1537-1552
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