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Photonic microscopy

Photonic microscopy

PLATFORM LEADER

Bertrand VERNAY

La plateforme de microscopie photonique de l’IGBMC offre l’accès à des techniques d’imagerie de pointe en microscopie optique et est spécialisée en imagerie des processus dynamiques du vivant au niveau moléculaire, cellulaire et de l’organisme entier. Les chercheurs peuvent analyser, de manière intégrée, leurs modèles d’études à différentes résolutions, allant des structures cellulaires les plus fines aux fonctionnements complexes des organes in vivo.


La plateforme propose des prestations de services et des formations en microscopie optique et analyse des bioimages. La plateforme collabore à des projets de recherche technologique et de développement avec les équipes de recherche et les plateformes et services de l’IGBMC.


Pour contacter l’équipe de la plateforme, envoyez un mail à l’adresse générique groupe-mic-photon@igbmc.fr. L’équipe de la plateforme vous recontactera pour étudier avec vous la faisabilité du projet, la meilleure stratégie d’imagerie à utiliser et la nature des services que la plateforme peut vous offrir.

Collaborations and networks

The facility is a member of the following network :

Funding and partners

The light microscopy facility is accredited by IBiSA since 2013 and CORTECS since 2021.

Resources

Confocal and biphotons microscopes

  • inverted Leica SP5  equipped with an environmental chamber and a multiphoron laser (680 - 1080 nm) for multiphoton imagign and photoabaltion
  • inverted Leica SP8-X equipped white laser and an environmental chamber
  • inverted Leica SP8-UV for photoablation, uncaging, DNA damage and photoactivation experiments
  • upright Leica SP8-MP equipped with an environmental chamber and a multiphoron laser (690 - 1080 nm) for multiphoton, intravital, photoablation and SHG imaging

Confocal spinning disks

  • Yokogawa CSU-W1 (Leica DMi8) equipped with an environmental chamber, FRAP, TIRF 360° and Live-SR super-resolution modules
  • Yokogawa CSU-X1 (Nikon TiE) equipped with an environmental chamber, FRAP, photoablation and Live-SR super-resolution modules

Lightsheet microscope

  • Leica Digital Lightsheet (restricted to small samples size (<2 mm)) for long term and low phototoxicity live imaging
  • Videomicroscopes
  • Zeiss Axio Observer Z1 for cell live imaging and medium throughput screen

Widefield Microscopes

  • upright microscopes for fluorescence and brightfield
  • inverted microscopes for fluorescence and brightfield

Macroscopes

  • Leica Macroscope Leica for fluorescence and brightfield

Laser microdissection microscope

  • inverted Zeiss Axio Observer Z1 Microscope  with PALM MicroBeam microdissection module and environmental chamber

Cell culture and sample preparation

  • Cell culture room with cell culture laminar flow hood and cell incubators
  • Laboratory space for sample preparation equipepd with a chemical fume hood

Bioimages processinf and analysis

  • 4 workstations with a suite of software (Fiji/ImageJ, CellProfiler, Icy, QuPath, Metamorph, Imaris, Matlab)