
Expression et réparation du génome
Membres
Chercheur(euse)s
Post-doctorant(e)s
Doctorant(e)s
Ingénieur(eure)s
Stagiaires
Anciens membres
- Dr Laurent Schaeffer, Directeur de l’Institut NeuroMyoGene
- Dr. Valentyn Oksenych, Chef d’équipe NTNU
- Dr. Pierre Chymkovitch, Chef d’équipe Oslo University Hospital
Expression et réparation du génome
La transcription, l’une des étapes clés de l’expression génique en réponse à divers stimuli de l’organisme, tels que le stress ou les hormones, exige une combinaison de facteurs. L’action néfaste d'agents chimiques ou physiques qui provoquent des lésions dans l’ADN perturbe l'expression des gènes. Si ces lésions ne sont pas éliminées par des systèmes de réparation efficaces, elles seront à l’origine de mutations pouvant mener au cancer ou accentuer le vieillissement. TFIIH, un complexe composé de dix sous-unités, joue un rôle clé à la fois dans la transcription des gènes et dans leur réparation. Des mutations de certaines des sous-unités du TFIIH sont à l’origine de trois maladies génétiques, le xeroderma pigmentosum (XP), la trichotyodystrophie (TTD) et le syndrome de Cockayne (CS), dont le phénotype résulte de défauts à la fois de réparation de l’ADN et d’expression génique. Les patients XP développent des mélanomes très tôt au cours de la vie alors que les patients TTD et CS vieillissent prématurément. Avec l’aide de la biochimie, de la génétique et de la biologie cellulaire, nous étudions les mécanismes de vieillissement et de cancer dans divers systèmes cellulaires et modèles animaux déficients en réparation et transcription de l’ADN. Nous développons également un axe de recherche sur le mélanome visant en particulier à établir de nouvelles solutions thérapeutiques contre ce cancer.
Projets en cours
Notre objectif est d'améliorer notre compréhension des mécanismes qui régulent l'expression des gènes codant pour des protéines au niveau transcriptionnel et leur maintien de leur intégrité. La quantité grandissante de données montre que l'expression et le maintien de l'intégrité de l'information génétique sont intimement liés. Des erreurs dans chacun de ces mécanismes cellulaires cruciaux entraînent des maladies somatiques ou héréditaires comme le cancer, mais sont également impliquées dans des mécanismes naturels comme le vieillissement.
Notre équipe tente de répondre aux questions suivantes :
- Comment les facteurs de réparation et de transcription participent-ils à la transactivation de gènes spécifiques?
- Comment la transcription est-elle liée à la réparation de l'ADN?
- Comment les mutations trouvées dans des maladies génétiques ont elles une incidence sur le programme transcriptionnel d'une cellule spécifique à l'origine de maladies somatiques comme le cancer ou les dysfonctionnements hormonaux?
- Comment l'efficacité de la suppression des lésions de l'ADN joue-t-elle un rôle dans le traitement du cancer ou dans le veillissement?
- Peut on cibler l’expression ou la réparation de l’ADN afin d’éliminer les cellules cancéreuses ?
- Quelles sont les deregulations transcriptionelles qui prédominent dans les cellules cancéreuses ?
Collaborations et réseaux
- Dr. Poterszman, IGBMC: Structure/fonction de TFIIH
- Dr. Davidson, IGBMC: TFIIH et mélanome
- Dr. Ali Hamiche, IGBMC: Remodellage de la chromatine et histones variants
- Pr J. Kraemer, National Cancer Institute, Bethesda: Patients XP, CS et TTD
- Pr. M. Zurita, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico: Modéle drosophile et XP, CS et TTD
- Dr. J. Svestrup, Clare Hall Laboratories, Cancer Research UK London Research Institute, UK: Expression du génome
- Dr. P. Brousset, Université Paul-Sabatier, Toulouse, France: Biologie du cancer
Financements et partenaires
ANR
Fondation ARC
INCA
Labélisation Ligue contre le Cancer
PharmaMar company
Prix/Distinctions
- Prix scientifique - Comité Alsace de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 2014
- Prix Olga Sain - La ligue contre le cancer - 2013
- Grand Prix - Fondation pour la recherche médicale (FRM) - 2012
- Prix Henry et Mary-Jane Mitjaville - Académie Nationale de Médecine - 2009
- Prix Duquesne - Ligue Nationale contre le Cancer de Paris - 2009
- Prix Charles-Louis de Saulses de Freycinet - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2008
- ERC Advanced grant - European Research Council (ERC) - 2008
- Membre de l'Académie des sciences - Académie des sciences - 2006
- Chevalier de la Légion d’Honneur - Etat français - 2006
- Grand Prix - Inserm - 2004
- Prix AGF/Athena - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2002
- Prix Descartes - European Economic Community - 2000
- Membre de l'organisation européenne de biologie moléculaire (EMBO) - European Molecular Biology Organization (EMBO) - 1998
- Prix Européen Jeanne Loubaresse - Institut Curie - 1997
- Chevalier de l'Ordre National du Mérite - Etat français - 1996
- Prix Tartois - Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 1996
Publications
2006
p8/TTD-A as a Repair-Specific TFIIH Subunit
- Frédéric Coin
- Luca Proietti de Santis
- Tiziana Nardo
- Olga Zlobinskaya
- Miria Stefanini
- Jean-Marc Egly
Molecular Cell ; Volume: 21 ; Page: 215-226
2004
Phosphorylation of XPB helicase regulates TFIIH nucleotide excision repair activity
- Frédéric Coin
- Jérome Auriol
- Angel Tapias
- Pascale Clivio
- Wim Vermeulen
- Jean-Marc Egly
EMBO Journal ; Volume: 23 ; Page: 4835-4846
A new, tenth subunit of TFIIH is responsible for the DNA repair syndrome trichothiodystrophy group A
- Giuseppina Giglia-Mari
- Frédéric Coin
- Jeffrey Ranish
- Deborah Hoogstraten
- Arjan Theil
- Nils Wijgers
- Nicolaas Jaspers
- Anja Raams
- Manuela Argentini
- P van der Spek
- Elena Botta
- Miria Stefanini
- Jean-Marc Egly
- Ruedi Aebersold
- Jan Hoeijmakers
- Wim Vermeulen
Nature Genetics ; Volume: 36 ; Page: 714-719
2002
Transcriptional Activators Stimulate DNA Repair
- Philippe Frit
- Kyungrim Kwon
- Frédéric Coin
- Jérôme Auriol
- Sandy Dubaele
- Bernard Salles
- Jean-Marc Egly
Molecular Cell ; Volume: 10 ; Page: 1391-1401
1999
Mutations in XPB and XPD helicases found in xeroderma pigmentosum patients impair the transcription function of TFIIH
- Frédéric Coin
EMBO Journal ; Volume: 18 ; Page: 1357-1366
Reconstitution of the Transcription Factor TFIIH
- Franck Tirode
- Didier Busso
- Frédéric Coin
- Jean-Marc Egly
Molecular Cell ; Volume: 3 ; Page: 87-95
1998
Mutations in the XPD helicase gene result in XP and TTD phenotypes, preventing interaction between XPD and the p44 subunit of TFIIH
- Frédéric Coin
- Jean-Christophe Marinoni
- Carlo Rodolfo
- Sébastien Fribourg
- Antonia Maria Pedrini
- Jean-Marc Egly
Nature Genetics ; Volume: 20 ; Page: 184-188
TATA Binding Protein Discriminates between Different Lesions on DNA, Resulting in a Transcription Decrease
- Frédéric Coin
- Philippe Frit
- Benoit Viollet
- Bernard Salles
- Jean-Marc Egly
Molecular and Cellular Biology ; Volume: 18 ; Page: 3907-3914
Affinity Purification of Human DNA Repair/Transcription Factor TFIIH Using Epitope-tagged Xeroderma Pigmentosum B Protein
- G. Sebastiaan Winkler
- Wim Vermeulen
- Frédéric Coin
- Jean-Marc Egly
- Jan H.J. Hoeijmakers
- Geert Weeda
Journal of Biological Chemistry ; Volume: 273 ; Page: 1092-1098
1997
Cisplatin- and UV-damaged DNA lure the basal transcription factor TFIID/TBP
- P. Vichi
- Frédéric Coin
- Jean-Paul Renaud
- Wim Vermeulen
- J.H.J. Hoeijmakers
- Dino Moras
- Jean Marc Egly
EMBO Journal ; Volume: 16 ; Page: 7444-7456