
Expression et réparation du génome
Membres
Chercheur(euse)s
Doctorant(e)s
Ingénieur(eure)s
Stagiaires
Anciens membres
- Dr Laurent Schaeffer, Directeur de l’Institut NeuroMyoGene
- Dr. Valentyn Oksenych, Chef d’équipe NTNU
- Dr. Pierre Chymkovitch, Chef d’équipe Oslo University Hospital
Expression et réparation du génome
La transcription, l’une des étapes clés de l’expression génique en réponse à divers stimuli de l’organisme, tels que le stress ou les hormones, exige une combinaison de facteurs. L’action néfaste d'agents chimiques ou physiques qui provoquent des lésions dans l’ADN perturbe l'expression des gènes. Si ces lésions ne sont pas éliminées par des systèmes de réparation efficaces, elles seront à l’origine de mutations pouvant mener au cancer ou accentuer le vieillissement. TFIIH, un complexe composé de dix sous-unités, joue un rôle clé à la fois dans la transcription des gènes et dans leur réparation. Des mutations de certaines des sous-unités du TFIIH sont à l’origine de trois maladies génétiques, le xeroderma pigmentosum (XP), la trichotyodystrophie (TTD) et le syndrome de Cockayne (CS), dont le phénotype résulte de défauts à la fois de réparation de l’ADN et d’expression génique. Les patients XP développent des mélanomes très tôt au cours de la vie alors que les patients TTD et CS vieillissent prématurément. Avec l’aide de la biochimie, de la génétique et de la biologie cellulaire, nous étudions les mécanismes de vieillissement et de cancer dans divers systèmes cellulaires et modèles animaux déficients en réparation et transcription de l’ADN. Nous développons également un axe de recherche sur le mélanome visant en particulier à établir de nouvelles solutions thérapeutiques contre ce cancer.
Projets en cours
Notre objectif est d'améliorer notre compréhension des mécanismes qui régulent l'expression des gènes codant pour des protéines au niveau transcriptionnel et leur maintien de leur intégrité. La quantité grandissante de données montre que l'expression et le maintien de l'intégrité de l'information génétique sont intimement liés. Des erreurs dans chacun de ces mécanismes cellulaires cruciaux entraînent des maladies somatiques ou héréditaires comme le cancer, mais sont également impliquées dans des mécanismes naturels comme le vieillissement.
Notre équipe tente de répondre aux questions suivantes :
- Comment les facteurs de réparation et de transcription participent-ils à la transactivation de gènes spécifiques?
- Comment la transcription est-elle liée à la réparation de l'ADN?
- Comment les mutations trouvées dans des maladies génétiques ont elles une incidence sur le programme transcriptionnel d'une cellule spécifique à l'origine de maladies somatiques comme le cancer ou les dysfonctionnements hormonaux?
- Comment l'efficacité de la suppression des lésions de l'ADN joue-t-elle un rôle dans le traitement du cancer ou dans le veillissement?
- Peut on cibler l’expression ou la réparation de l’ADN afin d’éliminer les cellules cancéreuses ?
- Quelles sont les deregulations transcriptionelles qui prédominent dans les cellules cancéreuses ?
Collaborations et réseaux
- Dr. Poterszman, IGBMC: Structure/fonction de TFIIH
- Dr. Davidson, IGBMC: TFIIH et mélanome
- Dr. Ali Hamiche, IGBMC: Remodellage de la chromatine et histones variants
- Pr J. Kraemer, National Cancer Institute, Bethesda: Patients XP, CS et TTD
- Pr. M. Zurita, Universidad Nacional Autónoma de México, Cuernavaca, Mexico: Modéle drosophile et XP, CS et TTD
- Dr. J. Svestrup, Clare Hall Laboratories, Cancer Research UK London Research Institute, UK: Expression du génome
- Dr. P. Brousset, Université Paul-Sabatier, Toulouse, France: Biologie du cancer
Financements et partenaires
ANR
Fondation ARC
INCA
Labélisation Ligue contre le Cancer
PharmaMar company
Prix/Distinctions
- Prix scientifique - Comité Alsace de la Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 2014
- Prix Olga Sain - La ligue contre le cancer - 2013
- Grand Prix - Fondation pour la recherche médicale (FRM) - 2012
- Prix Henry et Mary-Jane Mitjaville - Académie Nationale de Médecine - 2009
- Prix Duquesne - Ligue Nationale contre le Cancer de Paris - 2009
- Prix Charles-Louis de Saulses de Freycinet - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2008
- ERC Advanced grant - European Research Council (ERC) - 2008
- Membre de l'Académie des sciences - Académie des sciences - 2006
- Chevalier de la Légion d’Honneur - Etat français - 2006
- Grand Prix - Inserm - 2004
- Prix AGF/Athena - Institut de France de l'Académie des Sciences - 2002
- Prix Descartes - European Economic Community - 2000
- Membre de l'organisation européenne de biologie moléculaire (EMBO) - European Molecular Biology Organization (EMBO) - 1998
- Prix Européen Jeanne Loubaresse - Institut Curie - 1997
- Chevalier de l'Ordre National du Mérite - Etat français - 1996
- Prix Tartois - Fondation pour la Recherche Médicale (FRM) - 1996
Publications
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2010
-
The long unwinding road: XPB and XPD helicases in damaged DNA opening
- Valentyn Oksenych
- Frédéric Coin
Cell Cycle ; Volume: 9 ; Page: 90-96
-
Two sides of the same coin: TFIIH complexes in transcription and DNA repair
- Alexander Zhovmer
- Valentyn Oksenych
- Frédéric Coin
The Scientific World Journal ; Volume: 10 ; Page: 633-643
-
-
2009
-
Molecular insights into the recruitment of TFIIH to sites of DNA damage.
- Valentyn Oksenych
- Bruno Bernardes de Jesus
- Alexander Zhovmer
- Jean-Marc Egly
- Frédéric Coin
EMBO Journal ; Volume: 28 ; Page: 2971-80
-
Molecular insights into the recruitment of TFIIH to sites of DNA damage
- Valentyn Oksenych
- Bruno Bernardes de Jesus
- Alexander Zhovmer
- Jean-Marc Egly
- Frédéric Coin
EMBO Journal ; Volume: 28 ; Page: 2971-2980
-
-
2008
-
Dissection of the molecular defects caused by pathogenic mutations in the DNA repair factor XPC.
- Bruno M. Bernardes de Jesus
- Magnar Bjørås
- Frédéric Coin
- Jean Marc Egly
Molecular and Cellular Biology ; Volume: 28 ; Page: 7225-35
-
Dissection of the Molecular Defects Caused by Pathogenic Mutations in the DNA Repair Factor XPC
- Bruno Bernardes de Jesus
- Magnar Bjørås
- Frédéric Coin
- Jean Marc Egly
Molecular and Cellular Biology ; Volume: 28 ; Page: 7225-7235
-
Nucleotide excision repair driven by the dissociation of CAK from TFIIH.
- Frédéric Coin
- Valentyn Oksenych
- Vincent Mocquet
- Stefanie Groh
- Christine Blattner
- Jean-Marc Egly
Molecular Cell ; Volume: 31 ; Page: 9-20
-
Nucleotide Excision Repair Driven by the Dissociation of CAK from TFIIH
- Frédéric Coin
- Valentyn Oksenych
- Vincent Mocquet
- Stefanie Groh
- Christine Blattner
- Jean Marc Egly
Molecular Cell ; Volume: 31 ; Page: 9-20
-
-
2007
-
DNA repair and transcriptional deficiencies caused by mutations in the Drosophila p52 subunit of TFIIH generate developmental defects and chromosome fragility.
- Mariana Fregoso
- Jean-Philippe Lainé
- Javier Aguilar-Fuentes
- Vincent Mocquet
- Enrique Reynaud
- Frédéric Coin
- Jean-Marc Egly
- Mario Zurita
Molecular and Cellular Biology ; Volume: 27 ; Page: 3640-50
-
Solution structure and self-association properties of the p8 TFIIH subunit responsible for trichothiodystrophy.
- Marc Vitorino
- Frédéric Coin
- Olga Zlobinskaya
- Robert Andrew Atkinson
- Dino Moras
- Jean-Marc Egly
- Arnaud Poterszman
- Bruno Kieffer
Journal of Molecular Biology ; Volume: 368 ; Page: 473-80
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