Régulation de l’expression génique et cancer
Régulation de l’expression génique et cancer
Depuis 30 ans, nous étudions les bases moléculaires de la régulation de l'expression des gènes. Le groupe a travaillé pendant plus de 25 ans sur la structure et la fonction du facteur de transcription général TFIID des mammifères, de sa sous-unité TBP (TATA-binding protein TBP) ainsi que des paralogues exprimés dans les cellules germinales mâles du composant TFIID tels que TBP-related factor 2 (TRF2) ou TAF7L, publiant plus de 50 articles sur ces sujets.
En 2008, l'objectif principal du groupe est passé de l'étude du facteur de transcription général TFIID à l'étude de la régulation de l'expression des gènes et de l'épigénétique dans le mélanome malin. Nous avons d'abord concentré notre attention sur le rôle des facteurs de transcription MITF et SOX10 dans la prolifération des cellules de mélanome, en identifiant leurs gènes cibles, y compris les longs ARN non codants (lncRNA) qui sont maintenant au centre de l'attention, et en utilisant la spectrométrie de masse pour identifier leurs cofacteurs potentiels. Parmi les cofacteurs de MITF et SOX10 que nous avons identifiés figurent les complexes de remodelage de la chromatine SWI/SNF, NuRF et NuRD. Nous avons défini le rôle de BRG1, la sous-unité ATPase du complexe SWI/SNF PBAF, dans les cellules de mélanome humain en culture en montrant comment il est recruté par MITF et/ou SOX10 aux éléments cis-régulateurs conduisant l'expression des gènes impliqués dans la prolifération des cellules de mélanome. Nous avons défini le rôle de la sous-unité d'échafaudage BPTF de NuRF dans les cellules de mélanome humain en culture et dans la lignée des mélanocytes de souris in vivo où nous avons identifié son rôle critique dans la réactivation du programme d'expression génique des mélanocytes dans les cellules souches mélanocytaires adultes pendant la phase anagène. Nous avons également défini les rôles critiques de BRG1 et BPTF en tant que cofacteurs de MITF et SOX10 dans le mélanome de souris in vivo. L'étude du rôle de la sous-unité ATPase CHD4 du complexe NuRD nous a conduit dans le domaine du métabolisme des cellules cancéreuses. Nous avons défini un nouveau mécanisme par lequel la citrullination de l'enzyme glycolytique clé PKM2 régule la glycolyse et la prolifération cellulaire dans une variété de cellules cancéreuses.
Une liste complete de publications se trouve ici: https://orcid.org/0000-0001-5533-1171
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Publications
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2020
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Tuning Transcription Factor Availability through Acetylation-Mediated Genomic Redistribution
- Pakavarin Louphrasitthiphol
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Molecular Cell ; Volume: 79 ; Page: 472-487
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2019
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Les altérations épigénétiques dans les cancers du rein
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- Anas Fadloun
- Marc Rippinger
- Sebastian Lebedinsky
- Irwin Davidson
- Gabriel G Malouf
Bulletin du Cancer ; Volume: 106 ; Page: 839-841
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Dynamic Evolution of Clonal Composition and Neoantigen Landscape in Recurrent Metastatic Melanoma with a Rare Combination of Driver Mutations
- Guillaume Davidson
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- Erwan Pencreach
- Gabriel G Malouf
- Dan Lipsker
- Irwin Davidson
Journal of Investigative Dermatology ; Volume: 139 ; Page: 1769-1778.e2
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HCV-Induced Epigenetic Changes Associated With Liver Cancer Risk Persist After Sustained Virologic Response
- Nourdine Hamdane
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- Emilie Crouchet
- Houssein El Saghire
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- Marine Oudot
- Simonetta S. Bandiera
- Antonio Saviano
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- Armando Andres Roca Suarez
- Shen Li
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- Atsushi Ono
- Irwin Davidson
- Nabeel Bardeesy
- Christian Schmidl
- Christoph Bock
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- Joachim Lupberger
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Gastroenterology ; Volume: 156 ; Page: 2313-2329.e7
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Chromatin remodellers Brg1 and Bptf are required for normal gene expression and progression of oncogenic Braf-driven mouse melanoma
- Patrick Laurette
- Sebastien Coassolo
- Guillaume Davidson
- Isabelle Michel
- Giovanni Gambi
- Wenjin Yao
- Pierre Sohier
- Mei Li
- Gabrielle Mengus
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- Irwin Davidson
Cell Death and Differentiation
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Thymine DNA glycosylase as a novel target for melanoma
- Pietro Mancuso
- Rossella Tricarico
- Vikram Bhattacharjee
- Laura Cosentino
- Yuwaraj Kadariya
- Jaroslav J Jelinek
- Emmanuelle Nicolas
- Margret Einarson
- Neil Beeharry
- Karthik Devarajan
- Richard Katz
- Dorjbal Dorjsuren
- Hongmao Sun
- Anton Simeonov
- Antonio Giordano
- Joseph Testa
- Guillaume Davidson
- Irwin Davidson
- Lionel Larue
- Robert Sobol
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Oncogene ; Volume: 38 ; Page: 3710-3728
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2017
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Deciphering the Role of Oncogenic MITFE318K in Senescence Delay and Melanoma Progression
- Caroline Bonet
- Flavie Luciani
- Jean-François Ottavi
- Justine Leclerc
- Fanélie-Marie Jouenne
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- Véronique Hofman
- Guillaume Bossis
- Gian Marco de Donatis
- Thomas Strub
- Yann Cheli
- Mickaël Ohanna
- Frederic Luciano
- Sandrine Marchetti
- Stéphane Rocchi
- Marie-Christine Birling
- Marie-Francoise Avril
- Nicolas Poulalhon
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JNCI: Journal of the National Cancer Institute ; Volume: 109 ; Page: djw340
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Selective elimination of long INterspersed element-1 expressing tumour cells by targeted expression of the HSV-TK suicide gene
- Mariam Chendeb
- Robert Schneider
- Irwin Davidson
- Anas Fadloun
Oncotarget ; Volume: 8 ; Page: 38239-38250
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Hypomorphic Pathogenic Variants in TAF13 Are Associated with Autosomal-Recessive Intellectual Disability and Microcephaly
- Hasan Tawamie
- Igor Martianov
- Natalie Wohlfahrt
- Rebecca Buchert
- Gabrielle Mengus
- Steffen Uebe
- Luigi Janiri
- Franz Wolfgang Hirsch
- Johannes Schumacher
- Fulvia Ferrazzi
- Heinrich Sticht
- André Reis
- Irwin Davidson
- Roberto Colombo
- Rami Abou Jamra
American Journal of Human Genetics ; Volume: 100 ; Page: 555-561
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TEAD transcription factors are required for normal primary myoblast differentiation in vitro and muscle regeneration in vivo
- Shilpy Joshi
- Guillaume Davidson
- Stéphanie Le Gras
- Shuichi Watanabe
- Thomas Braun
- Gabrielle Mengus
- Irwin Davidson
PLoS Genetics ; Volume: 13 ; Page: e1006600
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