Chromatine et régulation épigénétique

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Chromatine et régulation épigénétique

DÉPARTEMENT

CHEF D'ÉQUIPE

La principale activité de recherche de notre groupe est d’étudier le rôle des histones variantes et de leur mécanisme de déposition dans le contrôle épigénétique de l'activité du génome humain, au niveau du génome complet. Parmi les divers mécanismes de mémoire épigénétique, le remplacement local d’histones canoniques au sein du nucléosome par des histones variantes a le potentiel d’affecter considérablement l’activité des régions génomiques correspondantes.

En effet, les nucléosomes porteurs d’histones variantes ont une structure et des activités fonctionnelles distinctes in vitro, et certaines histones variantes sont incorporées à des emplacements spécifiques dans le génome.
Notre laboratoire concentre ses efforts sur le rôle des histones variantes dans la régulation génique et le maintien de l'intégrité du génome. Nous avons récemment impliqué la variante macroH2A dans la régulation de la transcription et l’activité enzymatique de PARP-1 (Ouararhni et al., 2006), et nous avons découvert un nouveau lien entre les histones variantes, les facteurs de transcription et l’ARN non codant (résultats non publiés).
Cette association avec les facteurs de transcription et l’ARN non codant est une nouveauté, et nous aidera certainement à comprendre comment sont établis les domaines de la chromatine et comment l’information épigénétique est conservée et transmise aux cellules filles. L'altération de ces marques épigénétiques est associée à des troubles du développement et des cancers.

Membres

Chercheur(euse)s

Post-doctorant(e)s

Doctorant(e)s

Ingénieur(eure)s

Technicien(ne)s

Isabelle STOLL

Actualités

La structure quaternaire du GR met en lumière la communication allostérique inter-domaine

Dans le cas de maladies inflammatoires ou auto-immunes, moduler l’action du récepteur des glucocorticoïdes (GR) est une stratégie thérapeutique…

Publications

2020
- Hypoxia Inducible Factors’ Signaling in Pediatric High-Grade Gliomas: Role, Modelization and Innovative Targeted Approaches
  - Quentin Fuchs
  - Marina Pierrevelcin
  - Melissa Messe
  - Benoit Lhermitte
  - Anne-Florence Blandin
  - Christophe Papin
  - Andres Coca
  - Monique Dontenwill
  - Natacha Entz-Werlé
  Cancers ; Volume: 12
  HAL DOI
- H2A.Z is dispensable for both basal and activated transcription in post-mitotic mouse muscles
  - Edwige Belotti
  - Nicolas Lacoste
  - Thomas Simonet
  - Christophe Papin
  - Kiran Padmanabhan
  - Isabella Scionti
  - Yann-Gaël Gangloff
  - Lorrie Ramos
  - Defne Dalkara
  - Ali Hamiche
  - Stefan Dimitrov
  - Laurent Schaeffer
  Nucleic Acids Research ; Volume: 48 ; Page: 4601 - 4613
  HAL DOI
- Cryo-electron microscopy of the chromatin fiber
  - Ramachandran Boopathi
  - Stefan Dimitrov
  - Ali Hamiche
  - Carlo Petosa
  - Jan Bednar
  Current Opinion in Structural Biology ; Volume: 64 ; Page: 97-103
  HAL DOI
2019
- Generation of Remosomes by the SWI/SNF Chromatin Remodeler Family
  - Manu Shubhdarshan Shukla
  - Sajad Hussain Syed
  - Ramachandran Boopathi
  - Elsa Ben Simon
  - Sunil Nahata
  - Lorrie Ramos
  - Defne Dalkara
  - Cendrine Moskalenko
  - Andrew Travers
  - Dimitar Angelov
  - Stefan Dimitrov
  - Ali Hamiche
  - Jan Bednar
  Scientific Reports ; Volume: 9 ; Page: 14212
  HAL DOI
- CENP-A nucleosome clusters form rosette-like structures around HJURP during G1
  - Leonid Andronov
  - Khalid Ouararhni
  - Isabelle Stoll
  - Bruno P. Klaholz
  - Ali Hamiche
  Nature Communications ; Volume: 10 ; Page: 4436
  HAL DOI
- Coordinated Dialogue between UHRF1 and DNMT1 to Ensure Faithful Inheritance of Methylated DNA Patterns
  - Ali Hamiche
  - Christian Bronner
  - Mahmoud Alhosin
  - Marc Mousli
  Genes ; Volume: 10 ; Page: 65
  HAL DOI
- Centromeric and ectopic assembly of CENP-A chromatin in health and cancer: old marks and new tracks
  - A Sharma
  - S Dimitrov
  - Ali Hamiche
  - E van Dyck
  Nucleic Acids Research ; Volume: 47 ; Page: 1051-1069
  HAL DOI
2018
- Structure of an H1-Bound 6-Nucleosome Array Reveals an Untwisted Two-Start Chromatin Fiber Conformation
  - Isabel Garcia-Saez
  - Hervé Menoni
  - Ramachandran Boopathi
  - Manu Shukla
  - Lama Soueidan
  - Marjolaine Noirclerc-Savoye
  - Aline Le Roy
  - Dimitrios Skoufias
  - Jan Bednar
  - Ali Hamiche
  - Dimitar Angelov
  - Carlo Petosa
  - Stefan Dimitrov
  Molecular Cell ; Volume: 72 ; Page: 902-915.e7
  HAL DOI
- 3DClusterViSu: 3D clustering analysis of super-resolution microscopy data by 3D Voronoi tessellations
  - Leonid Andronov
  - Jonathan Michalon
  - Khalid Ouararhni
  - Igor Orlov
  - Ali Hamiche
  - Jean-Luc Vonesch
  - Bruno P. Klaholz
  Bioinformatics ; Volume: 34 ; Page: 3004-3012
  HAL DOI
- Thymoquinone challenges UHRF1 to commit auto-ubiquitination: a key event for apoptosis induction in cancer cells
  - Abdulkhaleg Ibrahim
  - Mahmoud Alhosin
  - Christophe Papin
  - Khalid Ouararhni
  - Ziad Omran
  - Mazin A. Zamzami
  - Abdulrahman Labeed Al-Malki
  - Hani Choudhry
  - Yves Mély
  - Ali Hamiche
  - Marc Mousli
  - Christian Bronner
  Oncotarget ; Volume: 9 ; Page: 28599-28611
  HAL DOI